Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Mouse element [ mm41 ]


Position: chr13:3,740,315-3,743,791 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: Asb13 - Calml3

Timepoints:
e11.5

Expression Pattern
branchial arch (9 out of 9 embryos) 

Embryo 1


Embryo 2


Embryo 3


Embryo 4


Embryo 5


Embryo 6


Fasta sequence
GGAACCTGGGAAGATGGAACtttctgactggtccctaacaattggccttcatgtctgact
ctggaccctcatctaagtcctcaggcctgcagagtgtctccttcaggctggtgtactacc
aaaggaaggcctggtgggagggatggtaaatcccgatggggctttacatcaagtgtgtgc
ttgcttagaagcagaggtcagaggtgttacaggagtgacagggtgagcaagggtatctaa
ggcttctaaccataactatttagattaggtacaatttctgaatttttacattacattgtg
tatttcattatatgtattttatatttatttatgttggctcgattgggtcatgtatatcat
taactttacagaaatgctaaatcataaaatacacgatagtgtatacatatgaacgtgtga
acatgtgaacatgtctgagtttgttgtgtgttggcacctgcttatatgtatgtgtaaata
tgtctgaatacacgcaccagcacatacctgtgacttttatgcatgtgtgagtgtttctca
cttggatgtatatctgagcatgtgagtatcttggcacatgcccattaatgtgtgcgtgtg
tgaatgtgtacagacttgaaaaaatgtctatgtgtacaagcttgaaaggcatgtctatta
tgttagtggttgtgtgactatgcatgagcctgttgtatgtgttaggaaatgcctgttaat
tgtgtgcatacacacttacatgtatatctgagtgtgttgctttttcctttgatgtttatc
tgagcatgtgaatctgtgagcacatgcctgcatgcttgtgtgagaatatatctgagtgtg
tggtatacatgtcagcacatgtctataagtgtgtgcatatgtgactgtgtggacacttgg
aagcatgtctacgtgtgtaagtttatcggtgtatgcttgaatgtgtgtgttccatatgtc
tcaatacatgcctgtgaatgtgtacatgtgtgattgcatgcagcccatcagcacatttgt
gtatatgtgtgactgtgtgtgagtgctttgtatgtatcagcacatgacttttgagtgcat
gtgtgtgtttatactactggatgaatgtcggggtattgtgagtgtctgggtacaagtgtg
tttctgagtattgtgagtatattggctcataagtgtgtgttcatacttactcagagtatg
tctgggtgtgtgtacatttacatgggggcttgcatcagagatgaagaggatactggttag
ctttctgttctcctcagttaaaagtcctgacaggcaggttcagggcctgggctctgagaa
aataggagatcagtccttggcaaaggttcaaggaacccccacccagaatgggcatgtttc
aagtgtgcatgttcaaatactgagtgccccctcccccatttccccttatgtttctgattg
ctcctccttgtccttattgaggggaagtggaaacaaatgtctggcaggaggccaaaagca
gagtggaaggggggagggagggagggagagagagagagagagagagagagagagcaggct
gctgtggcctctttagaggagaaagagcgggagggataaatgtgccagagatgaaacaga
gataggcaagaaagacacaaagggaaagataaagagatagaaatgtgtcagagactgaga
ggagagaagtggaaacagaggacagacaggtctgagggttccagccaggtcacagcaggc
agcagggctaggatcagaagtggttgggttctactaggggctgctcctgtgctcactgct
gagacagaactgacctcccgttttggtcccaacctttctgctttctgagtggtgaaacag
aggcataacaggccttggtctggaggcaagtgatgaggacagttgcccttctaaccagcc
cagcaccatgtaggcaggtaaaccccctcccctcataagaggctcatggatcagtcacct
ggtctgaagatctattgcgggtggagaaaggctaggctggcaggtagcctccctcatggg
gcctctggtgtagttcctgtgggggcctcctggggatgcagactcttacctcccttctgc
tccggttcactacagtacatgcaccatggcagagagatggtttcagttaaatccacagca
gttagatgaacaaaaagaaagcaaggtagtttcccctttaaggaattatgtgcagattca
atgcatgaatcatctggtccacatgtttacaagggaactgagtaaaagcagtcttctaag
gatttactcatggctgaagaaactggagaatcgtttctctttaggggtggaatgcagtcc
atattctgtcaggctttctaagtgagactgacgtttgtgaacttgtcattgagaagaaat
gtgttttatttaggattatttaggttttcctccctcagtatgattaatcaagagtaatat
ttctactaaagagataccactcacagttcactactctgttctgggtgctgggcagacaga
tgacctggctctgtcctcttggtgtcttgacccctgctgtgctacataagtccagggacc
acctggaaacagaacaggggatgtctccctgggctgctgtttgccttactcatgctcatt
tcctatgcttataggacttcataaacggggaaaccgaggcacagacactgaagcacctac
ctacagttgcatggttaataaactggatttgcataaagacatgatgccaccatggcccag
tttgtccttgtgtgggggggtgggagtgtcagaggaaactctttaagtggatgtgatacc
agcataagccaaaggggaagctttctggagaagtgaggactgaggaaagcatcatggtgg
tcctgttcatatggtgattggaagttgcacaggggttcccacttggtgagaagcttggtt
gcaaggagggagcgtctgagtgggtcggttgttttatctgtgggtttgccttttggagtc
ccaaaccctgtgtcctttatggttgcagctcatttatgagtattcataaaatagcaggtg
cctggcaatccagtggctgggttcctctgccctttggatcttatgggatgggctcaatca
ttaactaggtgctgggaagactgaatatttccaggagcatgccagagcagaatcattgtg
agaataagggccaaatggctgatgtcatcctgggaaggtcaccctctctgtgactcagtg
tattatcagcttccgcttactgtggcaaaatacccaagataatcaactatgttattagga
ggaaagattcattttggctcatggctttagtctgtgactgctttggggatgtgtggtaga
ggaagacatcatggtacgtgcaattgagtgtgtgtgggtgctcttctgtgcatgtacacg
tgggagctggaaatgaatgaatattcttctattgCTTGCCTCCTTACTGCCTTGagG
Primer
(+)GGAACCTGGGAAGATGGAAC
(+)CACCAAGGCAGTAAGGAGGCAAG


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.