Mouse element [ mm380 ]Position: chr4:89,112,773-89,119,591 (UCSC browser) Source: Lawrence Berkeley National Laboratory Flanking genes: Cdkn2b - Dmrta1 Timepoints: e11.5 This sequence did not show observable enhancer activities at E11.5 We define a negative enhancer at this developmental stage when at least 3 transgenics were obtained and yet no reproducible pattern of expression was observed. This does not mean that this sequence is not an enhancer at another time point or a weak enhancer at this time point but below the detectable range at our level of resolution. Fasta sequence GACTTGCAGAGGAGGAATGCtggggtgggggggtggtggggggaagaaagaacttcaagg ttttaagagggtggatttgtgcccctgaaataaattggtacaagtccttgcttaggctgt ttctccacctttccttcttaatagctacacacgtcacagtcagacccttgtatcagaaca gtgaaacttgatcccctaaatccaggcatcctaggacatagcagttccacctgtgtggtc tgtgacccagcagcaagcaactgtccttgaaattaaccagtatggccaccagtcctgtgc ctattttcatcacagcagctgattaatatagaactgcttaaatgggtcagggaattcatg aaaatgatttgtttaaacaattgtcacttattggcacttaccgagactatggctgccttc cagaggcaatcagagaaacctgaggacgtgccagcattggagtgtagccactgggatagt gagaattcttatcccagcacctttccaccttccccaccccaccccaccccccgtgacatt tggaaagttacccaacatttctgtgcttcagctccctcattgaatatggtataataatcg tgcttacttcataaagtcgtgaggcccctaagtcaataatgcatcttattctttacgtgg catatagaaagtgtccattctgaccacagtgaagataatggacctgtatctttaacattt aactatggttttgcttatccaaggtcaagtattctagtttaatggggttgtccaaacact gtaaaggtccctggatttcaagactgcagctctattgctctctcctctttacgccacttc ctttgaagaggcacgtatgttccagtccagtgactgagaacttggtggcggtgaataccc tgctgactttactctcacgtgcccttggtctgtgatccatcaaatcaggggagcccagga gtgtgttggtgaaaaaaggggaggaacaggaggggaaaaaaagtcgcattcttcatttcc caaatgccttccgaaaacagtgtccatttctcagatccttctctctgctgttctgtgggt gtggaagaactcacactgctgctgagctgtttcagtcaactcccaagtagacttgccaag aatggtcacagcaggacacctttgaaatactaggtttttggattaaagctttgaagatgt ttgccagactgcgccagtcatgattgaaggacatacgccctctatgggctagttgtccat aataaagtgaattcccttaccacacatggccttggtaacactactcaggcagagagcact tcatgcttgaagttcagtggctaagttaaaatgttccagttccagtagagctcagatctc atctggaacttgaaactgtgcttagctaacttttcttaaatcctgcttttgaagttaata gcttgtggtcttggggactaactttgaacctctctgaggaattcatctctgaaatatggg caataaaaccttttacctaagttattgtgaggcctcaataagatttataacaatctctat tatagattttccatacacatgaatgtccttgtttttatccttttcttatttcttttctta gtttcttaggatcacattggagtcctgctttctcagagctaaagcattttataaaaagca agtcagcctctggcataggcataagctaccctcatgtgtttagttgacttgcgagtcaaa gggccacaatcttcatttatattttgtgttatgctggccacttgcagcagatgtataggt acccagagaacatgggaaatcataagtgtttcccaatgaatcactgcctgtggagggctc tttttagcatgtggagggctctgtgattatgaacctaggccattcccttcccattttaca gactggagaaatgaaacacaggaagacaaaaggtgatttcccaagtgtataaataaaggg cagggcagagccagagtagaatctgcccaagcttactttcttgcctaaaaacattaccat taatatttaaaatattaaaattacattctaatgattgtttctatgtaggtaagcaggatg aaggaaacaaaactttacagtgatagggtctcatacacctcttctggggtttcctctata ttcctgtccttgttattaccatttccactacagagaccaaagcattgtctctacaaggtg ccgaggctgatataggcattgtccatgcattactagtcatcctaagagcaaccttagatt gtagtaactattacccttaacctaccaatgaagaaactgaaaagcgcagaggtgtaatgc tactctgaagtgactaaaatttaacctaaagactttggttctagattttaaaaatccaca cgtctaatacagagagacatattaaaaaaataaagctgaccagggctaaagtaccaggca tgatttctttcttgttcagaggggcttatagctcttggttactgccaaggcataattact actgttgctcattgaggaatagcttgctggactggtcattgctggagttcatagatgtca cagttgggtaagacttttaattacctcactcaatatgatagttcctggctccacaaaaag aatacagctgcctaaaaataaatgaaatgaattgcttctttcctttggcagcttgcatag catcttctgctacttgaaagctggtcctctgggagggggctttgaggtcatttccagttt tactgcctctcacttctgtgtctgaagcatgcagtgccctcagcaacaggggataacctt caacactaggtggtaattaggagaaaagctatagcctagttatttggggagtattttggg ctactccaatgaacaacttgaaaggaggtttctgcagtttttgtttgattatctatggct tttgtggggagtattattactcaaagtgctataacgttttttaagttatgtacctatata tactcacatatacctatttgtattttatgtgattttaggtacctgtacaataatatggtg cactagggctttctcaagcatccttagtgtgtcttatccatttccaccttctctttgtgt tgttctccctccttgctccctgcctaagccccatttcctgtttttaccgtttccccttta tatcactttaatccccatgattcccttctctagagctccactcctgatctacagtctctt aatgttggattggattctgttgttcctccaggctatatactcacctcggaagatctggag caggaaccacggctgagagagaacatgcagggttggtctttctgcatctggtttacctca ctcaatatggtattttatggttccaaaaaagagaatacaactacttaaaaaaatatagaa gaaacttacaatcctataagaaaacaaaccttagggctggcgagatggcttagtggttaa gagtgccgactgctcttccgaaggtcccaagttcaaatcccacatggtggctcacagcca tccgtaatgaaatctgatgcccttttctggagtatctgaggacagctacagtgtacttat atataataaataaataaatcttaaaaaaacaacaacaaagaaatattataagaatgtgct ttaaaaaaaaaaaagaaaacaaaccttaactgagcacaacttcctttttatattatagta caactacacttgttcttaatttttaaattaagcctttgagattaataatgcacattactg ttgcacattaaatgtattggtttaatacagttaatattaaggagaaaatagtgctgaaat cattcaattttgtgtcccactacttttgttgaaagggtttatcagttctttgaggttttt gatggagtctttaatgtcacatgtataaaataatgacatcttcaaataatgatagtttga cttgatcttttcctatttatatcactttatattattctcttgtcttactgtactagctaa gagtccagacactattttgaataggggtttagacaatgtgtcttgctcttagcaggtagt gtgacattggctttaggcttgttgtggatagcttttgttaggttgatatatgctcccttc aagacttttgtcatgaagggatgttgaattttgtcaaaggcttttgtatgtatctactga gataattttgtgattctatctttgaatcataatgtggttcatattgttatctatgtattt gttagataacaataatagatatatctatgtttaactgtgaaatgaagacaacttggtcat aatgaatgttcttcctgatgtaatcttgaattcagtgtgccagcatttattgacattttt ttttgtctatgtttatcagcgagattggtctgtactgtgtgtgtgcacatgcgtgcttgc acgagtgagagtatgtttatctgaattaggcaactatagtaatgtgaacataggtgtggg aaaatctcagtgagttttatgacagacagcagggctaaggtgagtagtataagtttccat ccaagcacataagtgtcttttatagccaaggtgatgaaagaaagaataacaactaacagt tcagcagaaggactgggagagaggttcctctgaaggataaggagcagatgaagcgaagct tccagggcagagaagtagcttggcaggtgctgctcctatgaaaactccaggcccagatgt gatgacactgagaaaataaacttaaaaagacagaaaattcataggcagtacaactctgag gcaaaagggtcagagagcggagaccattattagtatttaaaagcctattgtgtggcaagg ggaagagatttatctgtctcactgtgcgggacaatgaggacagatggctgcaatgagaga aagatctaaaccaaatggagaccctctcatggtcaactcatagacagcacattgaccgtt acgcagtcatgtgtttcttggtcactattgatagaagtgtgaggtggacagttatttact tgaaatgatgtaaagaacaaaatttatagaataataagtattatgttagtttcctttcta aggcttatgaatacatcatttgcatatgtaaacatacaagttgataatcattggccttgt gccatgatttcccccagtttttataggtatacattgcttacataatttagaaaaatttaa acagcatttttcttaacctataaaagcttaattttattttctgaggtcattactaaggac cgagatttgaatcagtatgtgtgacttaaaatctcgactttgttcgggatttcagctcac gcatcaggggattgtggtggaagtgggaaaatgaagtgtggagataatgagggtagaaaa ggagttgtaggctaagagctttcaataagcaaacagtctattgtgaagccccactgggaa gtgaaagaatgcaatgctaagttggttgaaactgaattgtcacaaaaacagatctgtcag aaaatgggcagcctcgaagcgtgcagtcactgtgcagagcccagatggaaagccgagaca gattagtcttttctttttctctcggattttaggctctttataataaacaatgtccctaaa atgctatgttcccttcagtataggaaagtatttttatatctcagtcctttctcatcattt aatatatatatattaaacaaaaaaggaccatggctatggggtagaatagtctttcaccgt gtcacagcccaaagtggtctcagctaagttggaagttgatagcagtatttgcatagtcag tgtggtctgcctccaggagagagctaggtgttttatgaccaccgctttatgagctgtggc tataaaatcatcagtcttttaaagcaaacatgccacagtgtctgcatccaaatgggaatt gcccctcagagccatgaccttgggagaatttcagacatactggcataaaacatacttaaa tccttcctggaaacatacatcaaaaccagtctttatggtgctaccaagtctttctatttg cctgcctctttctatcttttccttatatacacaaagacagaaattattagccacaatttt atattgcttgataactaattccatttcatttgttgtttttttttttttttgcatgtgcat gtatgtacttattcgagttggtttgtatatgtgcatgcagaggttgacttgaagtgtgtt cctcaattgctctttgatttatgttctgaagccatgtcttgatgagcctggagcttgcag gttggttaagatcacttgctaatctgcctccagagatcctttgcctccacttcccaatca ctgggattgcccagttggtttttatgtagctacagaaaacccagttttcctgcttccatg gcaaacatttcatctactgagctatatccatagctcagttttttttttaatattatttgg ctatgattatcttggttgcttcaaaagtcaaattcattttttttgtttgctgttgttttt tgtttttagaaacagggattctctgtatagccctgctgtcctggaactcatgctgcagat gaggctgacccttgaagtgagagagctgcttgcccctgccttcttactgctgagattaaa ggcaagtgacaccactgtccagctaaacctattcttataacttagaagttacagtgaaca tattacaaccaaagaagtatatagaaaggcagctgattctcactctacattcaaggaaga gttataaaaataccagggaCTTTGGCAGTCCCCTTAACAPrimer
|
For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.