Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Human element [ hs2571 ]


Position: chr3:156,964,955-156,970,887 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: CCNL1 - VEPH1

Timepoints:
e11.5

Expression Pattern
heart (4 out of 5 embryos) 
midbrain (mesencephalon) (4 out of 5 embryos) 

Embryo 1


Embryo 2


Embryo 3


Fasta sequence
CCCAGAAACCTCTGAACTTCCacgtatttcccccgagcctgtcctttctagtggtttgaa
atttaaaacaaactggctggacttcagcttagttaatggtggcagagaacaaaatagaca
taattttcataatgactttttcattttgggggacatcacatttttcacagcagcttttgg
ttaaacaacagaggcaaaaccttcactacctccctaacttcctgtttttctgaaactgat
atcctgcatttggaaatatataaataaataatagagaatcctgattccacttggataagc
cttgtttgaaagttgaacagtctgtccattcctccacattaaaatatattcctgactcca
ttgtgacttactgcacgctgtctgtttgggccacatggttctgagcacccaccccagtca
cttttatttttttctatgtactagcattgtactagtggttttcctgaggaatgttatttt
gaaacattgtaacaatcagtttgtttataacaatcagtctgttaacccatgttttttttt
ttagttccttgttattagtttagtcttctgcagtgccctttggcccatcccctggccttt
ctaccccttcaaattaggcagaaggcatccattgcctcagaaaaaggatgttgaaaagaa
atcagaagtaacagtaaactgtaagtttcaaaaatctattctgaaacttacctgttaata
ctttgagaaaagtaagattaagtctcaaaggtcaggattaaaattttttgacttttattt
ttagagacagggttctgttctgtcacccaggctatggtgcagtggtacagtcattgctta
ctgcaacctcaaattcctgggctaaagtgatcttcccgcctcagcctcctgagtagctgg
aactataggcaagtgccattgtgtctggctaatggaagtcaaaatttcgaggttaaaaaa
ttcataactctggctgggcatggtggcttacatttgtaatcccagcactttgggaggcca
aggtgggagggttgcttgaggccagaagtttgaggctgcagttagttagaattgtgccac
ttcactccagcctgggcaacagagtaagaccccgtctctctaaaaataaaacgaaataaa
ataaaaaaataaaaaaattcataactctgaagaactagattatgaatcttgtggcataaa
taatacatttggaagaatacttgttgagaagagaaactagaaaaaacctgaataaatgga
gaatattctgagtttgactgagtttatcctgaatcaatgaacactgctttttttgctctc
aagtgaaatgggatccagcactcaagcaataaattaattaaaacataaggaaataaagaa
aattatattatttgtatgtttgaatttgtaactagggtttgcacccttacatatccttct
gaaacatgctgttgcacttatggagagatattgaagctgttgttactatattacagtgtt
ctctttgtaaggccgataggaaaaaaattcttgggtctcattgttgagagagcttttctt
cctctgggcaactggtttatttttagcctggggaaactctgactcatgaatctgattgaa
tgcctcccttaactggctgcatgaaagcatggtgtcaactctgaacgctgtcttttgctg
ggatcgagtttcatctacttaccttatcccagtgactattcttcttcccactttgttttc
cttttgcctttatgtctttacttactctcaatctgtttggacttcctgggaagcagactc
tgaggcagtgtttaaggcgcaggatgcctattaaggagcaccttggggaccaacacctgc
agaagggagtggagaggaatcagtaaggggcaggtggagaaactgagcttcagtgtcgcc
ccagtgatagtctcaactgaccatgtggagagctctgcaggtagaatggtccctcagagt
tgtctcaacttgggcctgaatgtccaggtctttacactctcccattaactgttcactaga
tgtcaggtgccccaggcatgaccttggccaggaggcagtccttgaggggaatggcagctg
aaggctgtctgccaacagcagtcccagcagctggggcaccaggtccttcagtgagggatg
ttggtgatgcatcagtgcccaccatacttactttaaaaaatctagtatatatttctacaa
gaatttggaacaaaaacaccaataaaataagtaattaaagttaagtgactcttgttctca
tccttgcccatttatgttgtctcatcttaagtgtgatcctgagtcttggcatatgtcatt
tctcttttttgactgtgagagtgtgaaaggcgaggtctaaaatataagaaaattatattc
ttccttcaacatccagcatatcatcaactcttcagtggaggtttagttgactccccaggc
agagccagcagccccctcctctgtctccatcatgcccccacatcacagtgttgtgatctc
cacacatctgtttctttcatgggcaagatgtccctcaaacctgatcccttttgaatgctc
cttttatcatgaatggagctaccgccaacccacgggtgccgggattctggagacaattcc
cgtcaatcaccaagtcctgcaatttgcatttctaaagtctctctctaaccctctatttct
ctccatttccagtgctgctactttctttcaagctttcgttatacctctcacctggactat
tgtaatagccttctatttttctctcagtttctattattgctttctcagcaaaccattctc
tacacagcaggtagaaccatcttacggaattgcagatctaatcataccatccctgtttta
aacccaacagtagctctcccacagccttcatgacttgcccacctcccagcctcaccactc
tcatccaccacactagcctgttttggttcctctaatgtgctacatgccttttctctccaa
ggtcttctcacattcagttcttcctggtctgcttttcttctacctctccctttgactagt
aatttcctgttcatctttcagatctcaggcatatgtctctttgtccaggaagctgtccct
aacttcctaattagatcagacctctcctttcacaatctcatatcagttgtgcttctttgt
aggataggtcgcatggcaatttcataattaagataatactttaacatttttctcttctac
taggatacgtatcccacaaagtttgagacatcttggtcacctcagcatttctaatgccca
gcacaggtcctgcacataggagatgttttatgtatggatttacttattaaataaaatata
cttattgtgttggtccatttgggctgcaataacaaactgtcttagattgggtaacttata
aacaacagaaatttatttctcacagttctggaggccgagaagtccaacatcagggtgctg
gtagatttgctgtctggtgagggcttgttcctcagagctggcgccttctagctgtgtctt
cacgttgggaaggacaaacaagctccttttggcctcttttataagggcactaatcccatt
catgagggcagaaccctcattatctaatcacctcctagaggccccacttcttaataccac
cacattggtattgacatatactactacctaatggttttaacatataaatttgggaagggg
ggtcacaaacattcagatcataacatttatttactgagtttgttaaaggcatggacaatt
tatttatcatttttgagtccccatgccctagtatatgttggatgctcagtaaatggtctc
tcctttccttccttccttccttctctctctttctttcttctttctttctttctctttctt
tctcttctttctttctttctttcctttcttctttccttctttcttttctttctctttctt
tcctttcctttctttctttccttctctctttctttctctctctttttctcctttcttccc
ttccctccgtccctccctccctccctccctcccttccttccttccttctttccttccttc
tttctcttgctatgttgcccaggctggagtgcagtggttattcacaggcacaatcatact
gcactatatccttgaactactgggctgaagtgatcttcctacctcagcctcctgagtagc
taggactacaggcatgtgccaccatgcctggctaataagtatttgttgaatgaatgtttg
aatcaaactatgtaaaaggttgtcttggggaagagggagcagacattatgtctggctgca
ggagggagaacctggactaaaggttagaaatgatggaacggcagaatttttcagaaaata
attatatggtatgaataacctaatgggaattatatttgaacatttctatattgttgggtt
ctgaatgatcagacgattatgaataatttttataattttagtagtttttggtattttctg
caataaacgttttcataaacagaaaaaatttattttaaaaagatgtgaactgatgataaa
ttaatgagttctctatccctagaagggtttgcgcggttgggaatgccacctgccaatgat
gacaagaaagggacttctccatggggtggagaggtttggcctggcaagtgttaagattct
tccaactccaatagcctgtgatactgttaactgaatgataaatgccaaatctccttgctt
agaagaacttggcctagtttatttggctgcctcacattctgctagtggcttcgttacatt
ggaaccttactgtgacactattggctacagtggaatttgatttgtatttacctgaggatg
gtacaactgcaggatttctggagatgacagtattatagtgataacaaaaacatgaatata
taggtaagagttgtttatgtggaaaattacatgatatccctccatgaagagtttggggga
gtcgtgatgaaaatgttctcaaatcaacacatacccttagtattatggttaattttccaa
aacaggcattgccaaactgtggttttggctaaattttaaaaatggaccttctgatttttg
tgtttatgagctagtttggcaaacagaatcattgtttctctctcttaagagaaatgacat
ttagactatttcctcatatagcaatagctctgaattaagagggaacagaacactcccaaa
ggaaatctggtgtatagaagtggatctccgttaagaatagtggaacacacataagagttt
cttctgattacatgaagtgccagcagagagagagagagaggagagggggagagggagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggacagatataaat
agaatataagataatgaagtaataggattgatttctacaaagcacatgtgaaaacaatag
ttctgttgtcataatacctgtgtgatagtaaatgtgtgtttatatatatgtgtgtgtgtg
tcttatagatattctacttaatgttagtgaaatggtagttaaaaataaaacaaggcaaag
aataattctagaataattcaaaaatggaaaaattagaatttacttttattagcacccact
cccccttaatttccagtgtggtctcatggagcactgttattcctaggcatgcattagcct
accatgtgtttgaatactttacatttttacattatttgaaaattttataactcttctaga
ttctcagtaccaaaatgaattctaatccttttattgcttgaaagacagaaaaaatgcatt
tttaaatttgatgtaagattttcaaagatttgtccataaagtcataaataagctatgtaa
acacaatgcatctgattatcattttatagaaagTTCAAAGATTTCCATCCCCC
Primer
(+)CCCAGAAACCTCTGAACTTCC
(+)GGGGGATGGAAATCTTTGAA


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.