Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Human element [ hs2533 ]


Position: chr6:140,857,729-140,860,818 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: MIR3668 - MIR4465

Timepoints:
e11.5

Expression Pattern
dorsal root ganglion (3 out of 6 embryos) 
heart (3 out of 6 embryos) 

Embryo 2

Embryo 3


Embryo 5


Embryo 6


Fasta sequence
AAGGGTAATGAGGGGTTGGTggggaagatataaacagtgaatgggtacaaaaaaaataga
aagaatgaatgagacctactatttgatagcacaatagggtgaccataataataacttaac
tatatactttcaaataaagaaggtaattggattgtttgttactcgaaggataaattcatg
aagggatggatactccattctccatgatgtgcttatttcacattgcattcctctatcaac
acatctcatgtaccccataaatatatacctactatgtacccataaatgtttttaaaaagt
ataaaaagcaatattctaaaaaaattaaattatgaatatctacaaatgttctttctagca
aggttaaaacaactattaaagattgttgctatttaaatatatcataggaaaaatcaaatt
aaaattaaaaaataataaaaactcacatacttcaaagagcttaaaaaagtctttttaatg
aatttgttatgtgtttccacattaagtattaatatgtcatgctaatatatcacatatata
acttttcaaacttaacaatggtgcttatttgaggcattgtgaataattgaagttataaaa
atatatcacaaatacttttgaagaaatctgtaggtctactccaagccgatcacattgttg
tctctgtctggaaaatctcataacttcagtagcagagtctatttttggagttgaaaatca
gttcggtcacaataccagtgggatgactgaaggcttgggtaatgggctataaaatctttt
ccatctaggtcactgattgatttgagactgtcaccaaggtaggtagaaaaacagtcactg
ctgcctcataagaactgtcaaatcatgtgaaatgagaatatggtctcaattctggcagac
atttttcccatctacctaacacatgcatgcacgtgagcacacacacacttaatgacttct
tgggttgctttagagcagagtaaaattattctggaatgaatcttctgttctgtgcagaat
agaaaatattttgcttaatttgtccaagtggtgtcatcaggcaatttctatttcagaatt
aaagtgatccactttaccagggggactctttccacttgaatttttatgcctttgtagact
atggttaagtgaaatgagcttctcggctctttaactatgtgatcctccagtgcagtttat
tatttggaggaagcaacattttgtctgaatgattctaccaaataaaaacgaaaaagagtt
tagtttgatcagcaaagaatgtagaaatttacttaagcagtaaagaatgtggctgtctga
ctttggtattatgttacacctcatggttcaggcatcttgtttgccttaaatggtttcaca
agcaggagggttgacccagagcagattcgcagtggctgcacagagcacagctaaacagca
gatttaatgaggtcggaatttcacacaatgccttattcaaagaattcaggcagcaggaga
gaagttgtggtgaattgcagttgcccatggctttgcatcaagaagcaaaacgtttctcca
caaatagttcataaaagttcaaaaatagatgccaattacattcagctttaagattcagac
atttgtcagggagggggacttgtgtattcacattgttagaattaaggaagtacgttcatg
aaccaaaaatacagagctctatttactcgtctaaagtcaggaaggatcaaaagggtttcc
taatacattttgacatgctggaagtttttcctttgttttcccactttatgtttttgcagt
acctaccaccttatattgcattctttgcttgtctgtctcccctacttaactttaaagtcc
ttgaagacaggcatttggggtgccttaaatacttaatgaataattgcagagtgaatgttg
aacgaaaatgaatgtaactcattcacatactctatgctaaattgagaaataaaaagctca
gacattttcactccatcttattcccttaagaaacatcaatgtaagaattcgacagactgc
taatctctttgtgaagctaatgaccagctttaattttgcaaattaaatatccagtttccc
tgcctttttccccattgaaaaatagtcctatgttggtcatttatatagctcattattttg
gacctggggataaagctacagtcagaaagcacacagcctcaggttctataatattggaat
taggggtgagaacattttccctttatgtaagaactctgtggctctgggcatttctacata
attattgatcaaccttgaaccatagtttctcaaaaagtcatataaatgggagaggattga
ggtagaagtatgtgatatataatttattatctaaatttggacacttttgtctggaaagaa
aaagaagaaaagtaaagaaaaactgccaggatgctgggacaagaggtgcaccacatcctg
ctggggaaagcaaaccagaacatcaggtcatcctgggtagacacaacctgagccagtgag
caacactgcccccattccagctgatttctagtgtaattttccatcatctgcctttttaaa
tgtagaaagtcttgattcaggcttgactggaagtattaaatgtctacctcacttttgata
ggaagaagatgatttttcacctagtggagtcattgaacagtggtcttcaaattgggatta
tttccaagaatgtgagtacagacagttttaacagacttaattaaagctcctcacttacca
caattactcttttttagcatgatattgtttgttttttgtttaaaccccttaagccccttt
ccttaatataatagctatttacaaaaaataaaaatcactcattcatctcatcagatattt
caaattactcttgttgccttcattaaaatcccctaatcccactacagaaatttgtgtttt
tccctgtcttatacatatttctgttaagaaaggagcagggaataaaaaatgatgtatttc
tgtccttgtagactgttcttaaatcagatacatggtagattattggtggtagaattgata
gcaaatctgaTTTTATGGCCTCCTCTGTGC
Primer
(+)AAGGGTAATGAGGGGTTGGT
(+)GCACAGAGGAGGCCATAAAA


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.