Mouse element [ mm2177 ]Position: chr13:14,742,925-14,748,161 (UCSC browser) Source: Lawrence Berkeley National Laboratory Flanking genes: AW209491 - Gli3 Timepoints: e11.5 This sequence did not show observable enhancer activities at E11.5 We define a negative enhancer at this developmental stage when at least 3 transgenics were obtained and yet no reproducible pattern of expression was observed. This does not mean that this sequence is not an enhancer at another time point or a weak enhancer at this time point but below the detectable range at our level of resolution. Fasta sequence ACGTCTTGGATGATGGCTTAGTccctgggagctctggggggggggtggtctggctggttg atattgttgttcttcctatggggttagaaaccccttcaactccttcagtcctttctctaa ctcctccattggggaccctgtgctcagtctaaaggttgcctgtgagtatttccatctgta ttggctaggctctggcagagcatctcaggggacagctataccaggctcctgtcagcaagt gcttcttggcattagcaatagtgtctgggtttggtgtttgcacatgggattggttcctgg gtggggtggtctctggatggcctttccttcagtctttgctccactcttggttcctgcatt tcctttagacaggatcaattctgggttaatatttttgagatggatgcgtggccccatccc tcattcagggactggaactaacatctgaatgtagtctctaccggttctctctcccctttg ttgggtatttcagctaatgtcatccctgttataatctgggagcctcttactttcttggca tctggaactttctagtggatacccccagtttcccatccctcactgctacatacctccatt aaaattcatgacacttggtatttctcccccaactactcccacacccaatcctgctcccct ttccctctcccttctctttccgtcccatgtcccttactccctctacctcccatggttatt ttgttcctccttccaagtagaactgaagcattccacattttgatcttccttcttattgaa cttcatatggtctgtgagttgtcttgtgggtattctgagctgttttcctaatatccactt atcattgaatacataccatgtatgttcttttgtgactgggttacctcattcagagtgtta ttttcagattctatccatttgcctgtgactttcatgaagtcattgtttttaatagctgag tagtactccattatgtaaatgtaccacattttctgtatccattcttctgttgagggactt ctgggttctttccagcttctggctattataaataaggttgctatgaacatagaggaacat gtgtccttgttatatgttggagcatattctgggtatatgcccaggagtagtatggctggc tccttaggtagtactatttccaattttctgaggaactgccagactgatttccagagtggt tgtaccagcttgcaatcccaccagcaatggaggagtgttttttctttctccacatcatct gatgttgcttgagtttttgatcttagccattctcactggtgtgaggtagaattttagggt cattttgatttatatttccctgatgactaaggacattgaacatttctttaggttcttctc agccatttggtatttctcaattgaaaattctttgtttagttctgtaccccatcttttaat agggttatttgattctctggagtctaatttcttgagttctttgtatatatcagatattag ccctctatcagatgtagaattggtaaaaatcttttcctagtctgttggttgccttattgt cctattgacagtgtcctttgccttacagaagctttgcaattttatgaggtcccatttctt gattcttgatcagcatacaccattggcattctgttcaggaatttctctcctgtgccctta tcgaggctctaccctactttcccctctataggtttcagtgtctctcagtttatgtggagg tccttgatccactttcacttgtgctttgtacaaggagataagaatgggtcaatttgcatt ttttctacatgctgaccaccagttgaatcagcaccatttgttaaaatgctgtcttctttt ctttggattgttttagctcttttgtcaaagatcaagtgaccatatgtgtgtaggttcatt tctgagtcttcaattctattctattgatcttccttcctgtctctgtactaagaccataca gtttttattactattgctctgtaatacagcttgaggtcaggtatgctgattcccccagaa ggtattttattgttgagaattgttttcgctatcctggtttttgtttttgttttgttttgt tttgtttttgttattccaaataaatttacaaattgttctttctaagtctatgaagaattg gtttggaattttgatggggattgcattgagtctgtagaatgctttcagaaagatggccat ttttactatattaatcctgctgatccactgagcagttgggagatctttccatcttctgag tttttctttgatttctttcttcagagacttgaagttcttgtcataccaatctttgacttg cttggttagagtcacatcaaggtatgtgatactatttgtgactattgtgaagggtgttgt ttccttaatttctttctcagcctgtttatcctttgagtagaggaaggctactgatttgtt tgagttatttttatgtccattcactttgttgaagttgtttttcagctttaggagttctct ggtggaattttaggtgtcatttaagtatatgatcatatcatctgcaaatagtgatatttt gacttcttcctttccattttgtatccctttgatatcctttttgttgtctaattgccctag ctagaactttaaatactatgttgaataagtaaggagagagtgggcagccttgtctagtcc ctgattttagtgggattgcttcaagtttctctccatttagtttgatgttggctattggtt tgctgtgtattgcttttactatgtttaggtatgggccttgaattcctgatttttacaaga cttttacttttggttgttgtaatttttcaaacgctttttcagcacccaatgaaatgatta tgtcttttttcctttgagtttgtttatgtagaagattgttttgatggattttcatatatt gaaccatccctgcatccctgggatgaagcttacttgatcatggtgaatgatcgttttgat gtgttcatggatttggtttgccagaattttttatgagtacttttacattgatactcatac aggatataggtctgaagttctctgtcttcgtgtgattttggtatcagcttaactgtggct tcatagaatgatttaagttgtgtttcttctgtttctactttgtggaacaatttgaagagt attggtattagattttctttgaaggtctgatagaattctgcactaaatccatctggtctt gggatttttttggttgggagacttttaataactacttctatttctttaggggttatggga ctgtttagaaagtttatgtatgcttgatttaactttggtacctgctatctgtctagaaaa atcatccatttcatctagattttccagttggtttgagtatgtagtaggatctagtgattt tttttttgaatttccttaatttctgttgttatgtctcccttttcatttcagattttgtta gtttggatactgtctctgtgccctctaattattctggctaagggtttatcaatcttgttg atttttctcaaagaacccagctcctggttttgttgattctttgtatagttgtttttgttt ctacttggttgatttcagtctgcgtttgatcatttcttgccggtctactcctcttgtgtg tattcgcttcttttttggtatagtgctttcagatgtgctcttaagctgctagtgtatctt ttctccagtttctatggaagcactcagagctatgagttttcctcttaactctgctttcac tttgtcacataagtttgggtatgcagtgccttcattttcattaaattataagtctttaat ttctttctttatttcttccctaaccaagtaatcatcgagtacagaatcgtttggcttcaa tgtttatgtggttttctgtttttttgtttgttttttgtttttttaatgttgttattgaag accatccttagtccttgatggtctgataggatgcatgggatatatttcaatccttttgta tctgttgaggcctgttttgtgaaaaaaattatatggttagttttggagaagtactatgag gtgctgagaagaaggtatattcttttgttttaggatgcaatgtcctacagatatctgtta aatccatttggttcataacttctgttagtttcactgtttctgtttagtttttgtttccat gacctgtccattgatgagagtggggtgttgaagtctcccactattattgtgtgaggtgca atgtgtgttttgagctttagtaaagtttcttttatgaatgtgggtgcccttgcattaaga gcataggtgttcagaattgagagttcatcttggtagaattttcccttgatagatatgaag tgtccttcctttccctttttgataacttaggttgaaaactgattttattcaatattagaa tggctacaccagcttgttttttgggaacattcccttgaaaaattttttcttgccttttac tcagaggtagtgcctgtctttgtctctgagttgtgtttcctgtatgcagcaaaatgctgg attctgtttacatatctagtttattagtctatgtctttttatttgggaattgagtctaat aattaggtttttatggctctcttcttttgggtttgttgtaaaaagattaatttcttgctt tttcttgggtatagtttcctgccttgtgttggagttttctatctattatcccttatagtg atatatttgtggaaagatattgtttaaatttggtcttgtcacagaatatcttggtttctc catctatggtaattgagagttttgctgcttatagtagtctgggctgacatttttatctct tagggtgtgtatgatatctacccaggatctcttagggttgctgttgagaagtctggtgta attctggtaggtttatccttatgttacttgatccttatcactttcaatatttttttcttt gttttgggcatttggcattttggttattatgtgatgggaggaatttcttttctggtccat tctatttggagttctgtaggcttcttgtatgtttattggcatctttttctttaggttagg taagtttatccttaattttattgaagatgtttactgcccctttgagttgggaatctccac tcttttgtatacctattattcttatgtttggccttttcattgtgttctggattttCTGGA TGTTTTGGGTTAAGAGCPrimer
|
For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.