Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Mouse element [ mm2074 ]


Position: chr13:14,762,145-14,767,354 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: AW209491 - Gli3

Timepoints:
e11.5

Expression Pattern
facial mesenchyme (4 out of 6 embryos) 

Embryo 7

Embryo 8

Fasta sequence
GGATATTGGCCATATGTCTGtggcaaccattatgattgtgtgtgcatatgtctgtggtat
agatgcagttatatgattgtgtatgtgtaatatctatttcagatccataaggtatgcatg
tgcaatatttacatgttctttgactttgatgaaaaatccactcaaatgatagaagtctcc
tgtacagacacagaacatacacccccccccccagtccccatttccctggaaattgttaca
gctctgacccggagctgtatatccataatggaaagggaattcattccaaataaacaatgt
ctatagggctgagaaattcttgagaaaaaactcagtttgggttcctattcactctaagac
atttagatgtaatatttgctgatatgctttggttatgaaatactttggttaaaagatgaa
ggaggtaatttaagttaactgcagctattatatgtcctttttctggatctatttttgagg
attgtcttaatctatgtcacaagtgctgtcctctctggtcaaaggccacttgcttctttg
tcctttggcttttcaaactgtcacccattgttccaagtgttaataaccaagaacacacat
gtcctgatttcagctcttagcctggtttctgcattgcagtgcaattggttaatgctgtta
agattcggatatgctgcagccaccagagggagtattctgtctgaattggaattgccttta
aattcactgtacattcatgttttctccttgtaaaacgttaaaaaggacatgtcagacagc
ctgatctgtgcatttgattacatatagtgtcatgtctagaacatgcctatcatcctgccc
aacaggatcttccaattcttccaaatctccctatgcctttgataggggaagtccatgcct
ctcttcatcattgatctcaagggagccttgtaaactctgcatcccattcctgccatcact
gtaaaatcatggtatgaggttgtacttcaacaaagtttcctttttgttccttcatttata
aagtgagataactaacaatgttgaagaagaaacaaagtctcagcaatataaattaactca
gtgctaaagttaaatccacaaccagagattagcatctaagtcttgaggagggacatggac
agggaatgcttgatctaggtctccatccaagggggcagaaacatttccaggataggtggg
ttcttttcacacgaacaacatacaaactttaggattgctgtccattgttgtccaatatgt
tggccgtctgcagccttgtttgtatgaggctgagggacctcactttttaagtccaggaaa
ataaacaattggtaattttctgtggcttctgcatgaacctcacatctttccaggaaacag
ggtcattttaataagaagagcaatagataagcattctatgattctattccttcttgatta
accagtgttcttgtggtcctttattccaccactgcttttttgagttcttgtgtgacagat
actgagttatcttgtataaacttaaccacaagacaaatacttaatcgccacagcttataa
gcagtacgaggctaggtacaacttggcctttttattttatataactttatttttatgtgt
gcatatgttattttatatgatgtgcatatgtgtgcataggtgtgtgggcatacatgctca
cccacttgcagacagaagtagatacagactgttcttgtctatcacttgtagccttatttc
cttgataaagggtctcttgatgaaccaggagcttccaatttttggttttgttgcttgacc
aaatcctcagacattcttttgtctctgcccttttgctgactgtgacaggtacagatgtct
gcagttgtatccagcttttatgaggacgcagggatctggttctcatgtttgctagcaaat
agtcttactcactaagccaccttcccatcccagtttgatattcttacatgtacaccactt
tgtaattccataggtctggtgatatgaaatctcacatttccccccttgatgccttcaggg
ttattcctttatttattattaagtctaactcaatatctccagatctctgtcttgcctgcc
tataggaagtttatatttcctggccatttgtgatagactagaactgtgtgactagttctg
gtcaatgacataggaatgtctggtatttcacttctaggccagagcatcaataccagttct
acactagggacaacaagctccagagagaaatttctgctttagtgtagacagggagagttt
ttaaatatgtgggtcatggatatccaaaatgctaagctctggattatatttagaactcaa
atttgtaattactaggtataatagagcttattagttggtattttagaaaactagctagct
atgtagtataaatctttggacctatttctagagcactgattgccctagatgttaatgaac
atatagatgctcatctcctaccacatttttctgataacttcactcaaaagttcaagttac
tcataactgttctgttcaggagctaccctagatttcaaattcccacacaagcatccactt
ggttaggtttcatagtagttttattcattggaaaaatgttgaatatttgctatttctttt
cttttagcttttttattttaattgttgaattttattttatatgtacttgtgtggggatgt
cagatgccctggaactggagctaaagacagttgttatagaccgccatgctgaaaattgaa
cccagatcctttggaagagcagttagagttcttaaccactgagtcatctctccagctcca
cacttattcttttgagaggtgttgattaagaaatgaggaaaacttgggaacatttctagg
gcttcaacttctagacagtgctttcctgcttcttggatgctgtgagaccacctgcaggtg
tggtatacttgttaatttagatgaggaatactaaaaggtcctaagtgaagtcagtgcttg
ttgtcattatgctaatgcagtatcgaatattattatttaatgtcctgaaaacagctgggt
gaagaatgaaagtctcctaccacagccagtcgattcttcatataaaaatgcaggttcttt
tattttattaggggacaaaagtacttcaagcagatgaaaatcaagtgtgtaccaaaaaag
agaccttgttttcaaactataaaatttcagtggtctatgactttagatctagagcaaaga
agagtcaagtttctctccattgtaccttcagaggtaacttaaatacatgcctgttgagaa
cctgttagtgtctttgtattcaacaaattatatattaaagtagctttaaatattctgaat
aaaataatttcagagataggctgaaatattaaaaaagtatgacaataagtactaagtact
tagtatgaaagttaattttcctttatgaatagagactatctttattttaagaatttccag
atgtatatatctctgatttccaaaattttggtaagcaaggttctatgaacgaatatcttg
ctcataaatgctaatggaattcaatgtctaaacttgctcctttcttcttatatcaagatc
tatctggacaatcctggagatagaaaacccaggaaagagatgaggagtcatagatgcaag
catcactatcagaatacaagagatagaagagagaatttcaggtgcagaagataccatagc
aaacactgacacaacagtcaaagaaaatgtaaaatgcaaaaagctcctaacccaaaacat
ccaggaaatccaggacacaatgagaagaccaaacttaaggataataagtatagaagagag
ggaatattcctaaattaaagggtcagtaaatatcttcaacaaaattatacaggaaaactt
ccctaacctaaagaaaaagatgcccataaacataaaagaagtccacagaactccaaatag
actggactagaaaagaaattcctcctgtctcataatagtcaaaacaccaaatgcacaaaa
caaagaaacaatattaaaagcagtaagggaaaaaggttgaagaggtcagctcagagccat
tggaaaattccaccagaccccttccctcctggaagagacaggtcagagagcccataggcc
agagggagaggctgagtaagcccctacatcctcattccccgaagaccaatcagtttaaag
ggctcactgttccactaatcatattgtgcctagttgctgatgctctatttggcccctgga
aaacatataaaaactcgcagaaaggctattgcggcatctccttcaggtctgggacgaccc
cagtgcagtagaacaataaagtcctcttactttttgcattgattcctggctccaagtggt
tcattcaggtgatctctggtaagctaaggctcaccagtcttacttttagtgcattggctg
ggaatctgactcctagtgggaacacactggagcattgaattggaggtcttgagcttttac
cagggttcctgtttgtcttactgtttgtcaaagtctgagtctgtaagtctgtttgaactt
ttgcttgcaagtgttgtgaggctcagattacctatgttgtctggtgcagtgcagtcaatt
gcagcatgtagatctgccttaacgtcttaactgcaggatggggcaagggtggtggtggtg
gtgtgactgaaggatgcttcattggagccaggaaggctttgctctttctggaaacagcaa
gacagtatcggcgggagccatgtcttgctttaacctggtttatctggctcctgctgtatg
ggcagaggcacctggtttgtttccccacagctggagcaaactgtgtgttgattgtctttc
tctgtgttcttggacctggatgcccacttgtggcagggtctgtgtgttgattgtttttct
ctgtatttgttggtatctcattctgtgttcttgtactttgatgacagattttggacattg
gacaaactgaaagacaagttaataactctatgcttctctgcatgacccactcctagggac
ttttgacttgcaggtgatcaaagcagtacacgagagagtatttagatcaggagccttcag
gcacccggaccaagggcccagtatagttacctaggagaatctattggaggacccctgttc
tccctcatagataaaagactttctttcccaAGACCCACCACACAGGTTCT
Primer
(+)GGATATTGGCCATATGTCTG
(+)AGAACCTGTGTGGTGGGTCT


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.