Mouse element [ mm1963 ]
Position: chr13:15,532,865-15,539,602 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory
Flanking genes:
AW209491
-
Gli3
Timepoints: e11.5
Expression Pattern facial mesenchyme (5 out of 5 embryos) | nose (5 out of 5 embryos) |
Embryo 1

| Embryo 2

| Embryo 3

| Embryo 4

| Embryo 5

|
Fasta sequence
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