Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Mouse element [ mm1731 ]


Position: chr5:113,092,065-113,094,155 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: 1700034G24Rik - Myo18b

Timepoints:
e12.5

Expression Pattern
branchial arch (4 out of 5 embryos) 
facial mesenchyme (4 out of 5 embryos) 
forebrain (4 out of 5 embryos) 
hindbrain (rhombencephalon) (4 out of 5 embryos) 
midbrain (mesencephalon) (5 out of 5 embryos) 
neural tube (5 out of 5 embryos) 

Embryo 1

Embryo 2

Embryo 4

Embryo 5

Fasta sequence
CCCAGAGGGTCTTCAACAGTgtaaataaacaggttttatttctttgtaaaatctagttca
ctgggagtccctgcctgtagctatatacaagctccagcaggaaagacatccttgattgat
tactaatgtctgccctgggtgtagaggaagaaggtggcgacaagcttgttattcatcaac
tcctcccttggtgtgttcatgattacctgctgaaacccataaaccacaaagagctgagaa
cacaggactccagtttaaacggaggtttaaaacggctgtatttgtagctaactggttgat
atgagtaggcttttggggctctctcaaattctgctgcattaattattaagtttgagaaca
aagtaaaagatttaaccttgcaaaagaaattgaaagcgcttcccccaaggagcttgggct
atggctagaatgactttgggggtaaatccgaattcagagctggcttggccagctccagat
ccctctgtggccctgtgtcctctattttgaattgagggcattgtgataacctcaagaggg
ttgggtgaggtgaggctgtgaaccctgtccctgggctctgatgggcatccgcagagtcct
cttctgactgatggcattattagttcacatgagacggtccactcatctctcagaggctcc
atattactagagcaatcactcactccacagatccaaggcaaatgcatccttttgagcaga
tcagagcagtttgggcttctgcatcctttagagcagggaccccaggggagggaggaaagg
gatatcaaagagtgttctgatgtggaggaggctccggggagggaggcccccccccaaacc
ccatctgtgttgaatgtcttttagcattccttctcaatgaaggaatgcagccccatgggg
tgtggctggcaggcagctctgcagatgggaggtgaagcctttctgggattttctgtgcta
ttctgtagctccatgtacagtctgtgtcccctgttgggccaattactgacttaaaatgtt
gttagcaaaaggcaggcatgctcattattgtagcagcgagcatgaaggcccagtaggttc
ctatttatacagttccaacgagctattcttacctggccctttgtgtgtttgtcaccaaag
gcttccaaatcacaggacgtttgtcctaggtggctgtccatctcctcacacttcctccct
cctctgctctgcagggatcagcagggcctgaaatgttgggagccacctgggccaggaaga
agctcaagttgctgcagaagagagatgcctagtcattgaaagcaagagaagctgcagggt
gggaggggtgggtcagggcagtgtgggagatcacatgatacgggtactccagggaaggga
tttgaaccccgacctgttgtggtgagaggtagggaggacttgaagtcaggggtcctgggc
tctggataactgttttaaccttgagctagtcattgatgcttcctggctcccactttttct
gcagactctgaggtctgtgccgtgttctgcacaagcaggacatttgtcctaggtggctgg
gcctcaagtcacagagaaactcaattccaaattgtgcaaatatgtagctgtgtcctggat
ttgcctacacccacggtcacagaactaaaactccatctgcctggaatgtctcttaaacca
tctagtcggtctttattattgttttattttctcaaaaatattgtgtgtgtgtgtgcatag
tgcatgtatgtgtatgagtgtgtggtgaatgtctgtgtgtgtgtatgtgagtggtgcctg
tgtatatatgcacggtagatgtgtgtgtgtgtggtgcatgtgtgtatgtgtgtgtggtat
atgtatgtatgtgtatatatgcgtggtgtatgtgtatggtgcatatgtgtacatgtgtgt
aatatatgtgtgtgtgtatgtggtacatgtgtatatacgtgtgtagtgtatgtatgtatg
tatgtgtgtggtacatgtgtatatacgtgtgtagtatatgtatgtatgtatgtatgttta
gtgtatgtatgtatgtatgtgtatggtgcaTGTGCATGCATGGTGTATGTG
Primer
(+)cccagagggtcttcaacagt
(+)cacatacaccatgcatgcaca


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.