Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Mouse element [ mm1678 ]


Position: chr14:26,404,648-26,407,942 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: Mir3075 - Ppif

Timepoints:
e12.5

Expression Pattern
forebrain (5 out of 6 embryos) 
limb (3 out of 6 embryos) 

Embryo 1

Embryo 2

Embryo 3

Embryo 4

Fasta sequence
TGTGTTCAAGGCCATCTCCCtgtgtattcatgcctggtatttctggctgtgtgggtatgt
acatggtctgtgtgtggctgtatgtcatgcatgtgtacattgtattatgtgtgtatttat
gtacatatgtatgtaatgtgtatatgtatgtatatatgtgtgtttgcatgatcatatatg
ttcatgcctggtatgtctgactgtatgggtatgtgtgtacaaggtctgcatctctgtgtg
tgtggctgtatgtcatgcacatgcacatgtctgtctgtctgtttgcatactcgtgtatgc
tcatgcctggtatgtctgactgttgagtatgaacacatgtacctgaggagtcctgtgatg
gtggaggggtttcagtgcacagagacctataggtgttcacagatgtgtgtgggttctggg
ggtggtgtatgactgttacggaatggctgagcagtgtgtgcacgcgcaactagctgcatc
tatgggcgcctctcccacccttctgccttctgtctcgcctgtcaggaggccaggctgggg
cctgagaaggccctgcaatgagatcatgttgtgaggggagatgctttgtcaagaatgcta
ccaaagagttgggctgtgtgcgtggttgtggcagtgagcagggtggtgacggtgagcagg
ctcaggcctgggggcagcactgtatggcacgaaaatgagagagacagagacggaatgcag
agctgagcacagcccagacactacagcaagccgcccaggcagccgcctccacgtggggcc
ctctgatgcccagcccccaactctttgttctgctgcagcctttagcctctgcgcgcacgg
gagcaggagcacgcatgcgcacatgcacttgcatcctcatcttgaggctcctgaggggcc
ggctgcaccctcccacaccccccaccccttcctagatagaaggtcacctgcccagccccc
agcacctgacacatcccaggctctcctccaaggctgtagcaatgcccatcagccccctcc
accaccgcatgccagcccagagtaacttggcaggctgtactgtaatgtcagcctcttggg
cgctcactcagtggttcagccttctgttcagcctacatgggagcgagaaaccaggcagtc
gccatgtccgagggtccccaagagttgcctgcatgcctccgctggtgtctatgcttgaat
agatctatgtagcctcagctgaccctctgagcagccagcacatgttgaaatagcagaata
gagaatgtcagagcccagaaggtaagcagcccagggaccaaaggaaaggaagatgcgccc
caagctatccataatggggctggggcacaggtgggggtgccagctgcttttttttttttt
tttgtcttcttttttctccctggcatagccaatgcttggatgcttgggtggtttaaaggg
actattggtagaataggcacccagctactgtgggaggcatcaagaatacccaggccatcc
tgacaggcaccagcaagcttttggagaagggaccacaggaggcagaggaatgattcaagt
ggggacaggcagagggtgtttgccaatcttaacacagccaggctgcccagagctggctgt
ggacgtgggactgctgtgtggttttaggacatgcctgttagttatgtgcacttacttgct
cttcgtggagtagcaccatcacgcagatgttctgcatcctttgaatggaaaccttgggtc
tgcatccccaagatgggtaaagtctactgggttctctgacctctgacctctgttctaagc
acaccttccagtacagcagcccaggtcccagaacgggagtggaaataatgtcgcttgctg
gctttaagtccccagatgcatgcctgctctgtttccctaatgagtcatgtgcctgtcaga
tgtcagctggtcttagtggagacactgagacatgccttgcctctctctgcctgtgatctg
tggaagaggctcttaagagatactgggtctcactctagagctctcagttcagggataggg
gctggaatggggccttctacggcactagtgtggcagccccgtagttaatttgtcgtgggg
ctgggatgggacaaaggcacccaaaaccagtcaggtcatttcaacttctaccagccaggg
ctctttacaccagggaaggccggtcatataccagtgtcccattgctgtggaaacaagatt
tttttttgcactcaccgagctgcatggtgactctgagacacctccgtggtggacagcact
tctggtctctcatagtgtcgtggctgctatctctaccttcaccctcccccatagcctttc
tccaccctctctgcctctgcccaccccaacagagcattcagctgccttcccttcagcatg
gaggacaaatagccccattcaggggcacccgccagagctgtctctctaagacaaagctgt
gtgcagctccccgtgaaaaacggctcttggctgcccagcgagcaggcaggattggtgggt
gcagattgcaggggatttgttagtggctgccagttcccccagagatagcaggaaggcaag
gccttgtccttgaaacaccagcctgcctggcaggctggggcaccttctcaaggccaggga
cagacttcctcctggacaccatccccacccccacccccatgtgaactctgcagagctggg
ctgtgggggagggcttggcttccttccttctgccgggccttcgcccctcccaggccagat
cccatggaaatggctctggattttactgccagcctgtgggaactgactaaccatcagata
tgtgttgtggccaaaacctgtgttctctgtgccatgggagaggtcactggggctctgttg
ttagcacacccatttacagaggaggaaatcgaggctctgagagggacagacagactccag
ccctatagttctcagtgctagtgacagaatttgcttgaaagcgagtccagtttgggcccc
aggaagctatccctcctcctgagtgacccaggaagactggggcaatgaccctggttcccc
caactcccatctcgctgagggctgtgccatgggctcctgtaaccttgctctgctcttcaa
caaagaggaccagtgggaggaaacttgtgggcccagcattcccaggctaaggaactgggg
ggagggcagttggatgatccccagggtattaaaacctcactttggagaagaggcagagct
gtgttagaaagcaggcagatgtgggaagagcattgCACTCAGGGAAAGGGCTGAG
Primer
(+)TGTGTTCAAGGCCATCTCCC
(+)CTCAGCCCTTTCCCTGAGTG


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.