Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Mouse element [ mm1673 ]


Position: chr2:157,299,241-157,303,133 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: Src - Blcap

Timepoints:
e12.5

Expression Pattern
somite (3 out of 6 embryos) 

Embryo 2

Embryo 3


Embryo 4

Fasta sequence
TGTTCAGGTCCTGTTCAGGCaggcatgttggtgagacttcatttctgacactgtgaggag
tcacactctcacggcaggctctgtttctctggctctcagtctttctgtccgtcccctctg
cctctttggtgctggtgttaaagtcctgtgtctgctggaaggtggaggtgcacgttgtgt
tcccagcactcgggaggccaaggttggcagagctctattgagttcgaggccaacctcgtc
tacatacagagcaagttcaaggatagccagggccacacagagaaaccctaaaaaaaaaag
tcctgtgtcccattttcttttgtttgtttcatactccatactccgggtgtatgtatgtgt
gtgtgtgagagagacatctctctggctctgtttctctgtctctctctctgtctctccccc
ctccccccaatcccagcaggtctgtctttttcccattcattcattcattcattcatatca
cagacaaatgcacatggctttgatgtctgctggtctgcaaggggtggccccagccccagc
ccctatcctgtcttctatcctgcaggcctgggtttctgcaaagctcttcaaccccctgcc
ccttgatgcctcctccttccctctctcctagctccggctctgggggtcactgccatcggc
tggcggggggtgggggggtgggggggctgggtgttgtttcctcttactcccatagttctt
ctgaaaacattaacagtggagcggctgttcctacccagctgtgtgtgtgaaggagggaaa
ggggcagacagaggcccctgtccactcttccttcctctccctgtctccagggagctgagc
tgcccactttcggtcatgtcagcttttacagactgtgtgcatgcatgtgtgtgtgcttgg
tatgggttaggggggcttcactcacccatttcctgtcggcttccaggtctccctctccat
cctgattattccagatgtgtgggcttccctccgtgccacccacccccttcccctctgttt
ttataatctgcaaaccctggaagctcgcttcaccctcccttcctccaatgcgcagggaac
attgtttcatccattccctccctcagtccatccatttgttcccttgacagatttgtatgg
cgtccccaatgggagtgacttaggggctagaaaacaagctgggcccaccaaccaccttct
gtttaaatgacaagacaggacagatgctgaagtccccaggcctcaggagaatagagacag
gccctcctgagcttgtctggatggtagagtagaacttcagggaagtaaaagtctgattac
ccgtgggggtgtctatgtgtgtgcttgtgtgtgagcatgtgtcagtgtgcgcgtttgtga
gcatgtgtcagtgtgtgtgtttgtgtgtgaggatgtgtcagtgtgtgtgtttgtgtgtga
gcatgtgtctgtgtttctgcatgtgagcttgtgcctgtgtgtgagtttccttaggtctag
acttcccggcagcacctgacctcccacagtccaggtgtgtgaatcccctgagttgtgtgt
ggactgtggtacatgtgggtgtggctacaatttgtactgtgggagtatgacatgtggagg
gagacctctgataggtgaggtgtagtggggtacatagcttatgtatggtgtgtgtggtgt
ggtgggtgacacacagtgtgtgcagcagggttgtgatgtgactataggtttgaagggtgt
acaaggcatgtatgaagccttggtggtgtgatgctgagccttccctgtgcctggatccct
ttcatggcgtggacagagatgattccatgttacctgtgttcagactttgcacacacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacccccgcattcagccctctccag
ggtcctgcctcctccctggctgtttcccagtctttctttgtctcctgtgtctctgccccg
ggttacagccctgagtgtctctggcgctgattagtttcaattgagctgtgattgcagagc
ccctccctctgtgcgcctgcagcatcctctatgcccctcagcactcttcatcaatctctg
cccactcccaccccccagcttgttcaagtcccctcaggcatggcctcttggtcaggctcc
tgccctgctctgggcagctgcctcctcttccttagctttggggtcaccgtcattggtttg
gaagtgtttttcattcccggggctcttcagaaagggcctattgtgaagcaattgttgctg
ccgcccatgtgtctgactctgggagagtgtggggggttgggtggggtggggagacatgag
aagggtccttgcagcttctgccatgtggctttcatgcccatctctatgggccatgggtgc
ccatctgggtactcagtgctctttgtttccgtgtggccaagagcaagtgcgctggaaact
tgagactctgagcctctccctgccttgcctgtctccagggtgcttctgaaatctgcctgg
ccctgcgtgtgcagcattcagaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagctgcctggc
aacatgtcatctctgtcacttgctctaatcctttgtcccactctggggtcccaccccctt
tacattttcttttggtcagcacacactgaagctcctgtgagtgagcatgggtgagcccca
gccactgtctgtactgtgtgcctggcctgcaggcttgcccctctcccgggaccctttggg
gtaggagggcgctctcccaggctttgtacagggtttgcttatgctctaccgatatgttcc
aagacccacctgcccatccttctgtcctaccgtcctcctgtttgttcaagagtcatttaa
aatttttttccttttatttatgtatttagtgtgtgggtatgtgaatcaaataggttatca
ggcttggtggcaagtgcttttatcttctgagctatccctccagacagtcatttgtatttc
agacattacatggttttcgtttgtctgggtggtgagtatgtgctacaccacgtatgtagg
ggtccaaggacaacgtgtgggaattacttctcttttgttttgtgggtcccggggactgaa
ctcaggtcttcaggttttgtgctaggtacctcttcctgctgagtcatctcactggcactc
agaaatgatttccaggctcccatttggggtcacagtgcagagtccaggcatccaggaccc
cttgcctactgcccagccccctaaccctcacggcccacttcttcctttcacttccagccc
tgctcccactccctaccccgcaggccacaggcatctcttaaggcaattccccactgcctg
ctaaagagttttgtggtctctccttgcagataacagtctgctctttctctgtggtcctac
tgtgtgtgttgcttttgtcctggccttacttacctgggtggcccaagcaacctcacatgt
gaacctacagttgccaccctatcccgtgaatatgtgtcaccttctttttcttgacctctt
ccactttaaatcagggtacagcttgttgaccatgggataattgactctgaattttgtgat
tgtcccatctctggttgacatttgttttaaatctcaaacaaatgtgagggtgtttaaaaa
aagtatttacagagttatttaggagtcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtt
agcttcctcctgtctctttctgctctccccatatttcactgaattctgcctctttgctat
atgtcagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagg
gagggaggaagagaaggagggagaaatgacgggGAGGAGAGAGAGGGGGAAGG
Primer
(+)TGTTCAGGTCCTGTTCAGGC
(+)CCTTCCCCCTCTCTCTCCTC


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.