Human element [ hs1649 ]
Position: chr5:101,999,073-102,003,903 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory
Flanking genes:
LINC00491(intragenic)
Timepoints:
e11.5
Reproducible complex pattern.
Expression Pattern
| facial mesenchyme (7 out of 9 embryos) | | forebrain (8 out of 9 embryos) | | hindbrain (rhombencephalon) (8 out of 9 embryos) | | limb (6 out of 9 embryos) | | midbrain (mesencephalon) (8 out of 9 embryos) | | neural tube (7 out of 9 embryos) | | nose (7 out of 9 embryos) | | other (9 out of 9 embryos) |
Embryo 1
|
| Embryo 2
|
| Embryo 3
|
| Embryo 4
|
| Embryo 5
|
| Embryo 6
|
|
Fasta sequence
gttCTAGCCAATATTTGGGCAGGTttcattaacagtcgtgtgtcatggatgctggacata
attacctcaacagccttacatctagtcctagacaattttcatctcttatttggagacctt
tattctattttatcttatttcaagctatatttccaatgtcagattattttaaggatagaa
ggacttgacatttcaaatatcgatgaccaatcaagtcctttctgcttttaattttttatt
tcgtcacctgtttcacttattcttcaagggatggctgccatcaatgatcccataccagga
gagtgatttttttaccatattaaaacaccttcaaaccacagtagtaacaacagacttaat
tttcattaagagccaaagagagtctctcccttgcctttagtaatttgaatatttggcagt
aactcagctgtttagatattcagcatagccctttttcttctaatggttataggaagctat
gattaatgccccaaaggtattaacactacactttttcctttctgcaaaccagtccaatcc
agatatgtgagacagaagaggactgcctggacaggttaatcaccaaaaagattaccttca
cctacataagtcatagagcaaagtgtaatactggcttcatctctcaggcatggccatgtt
ccaataccttactcttggaaatctggcctcaccatttgatatcaaacttggtgtacaggt
ggtgctaatggaattttcctatcagccaactgtgcctttaagggagacaggattgatgtg
agatcttacaagctttcattatcatccagtgcttgtgtcacatagctgcccttccctact
tctcagccctccaaaaggcacaatgtcttccatcaggcaaaagtgacaccacaacattca
ttataggaagtaagagacattcatcactggaatattttagcaaatgaatcacaacagact
gatagcataactcatgttctaaggccaagaacaagaattgcatagtttattttaagacag
cagaagagtaaaaaacagattgaaaaacatatgataccctctccagctcagagctctaca
aacagcagtggcgtttgcaaagttctatgtatcttctcaaatgtggtttcagttttaatg
tgtgttgacatctttgtgtgcagaactaactggaggaacaacagtttgtgctttttttcc
cttcttgctacaagggtgagaacagggaaagaaccaaacgatctgtgtttactttgagca
gccatacaccatgcatggacactaaggtatggttttccttcaattattccaaattagtat
aatgaaaacatgcttatccctcgagccattagatgcgtataatgcagaagagatgcagta
atggagttgccttatatgctcctctgaagcagaagcaagtgaaagagacaagtaagatga
ttagaaaaactttgactttctaaaacaaataagcagtaaatgaactgattgagtgcaaaa
cttcacagaaccacacaaagaactggagcttcaaactgtaactttaaaaatagtagggtg
aaaaattaaggggctctaacatgaaacaaatttaggaagaaagagaaagcaacagcatgc
caagaactatactgattaggaagtaggcaatttaatttcttcaggagagtaaatctccaa
catgaattaatttgcttcacgctgagtcctgctggtttttcttcttccctcaatcactgt
ttatttcacaaaatcagcactcacctatcttctttgattatttaatttcaggaggatttt
cctttcacaaaacagttagcacagttaaacccggctctccatgtaatgtgtaaacatatt
acaatgccctccctaagtgtgaggattatttatttcctcttggagacaacattgtttcaa
tgctctacttcccctccagtacaatctctcagtgacaatcctgaatctacttcccactgt
gtgcatctttcattgacatttaccaaatgcacaggctctgatacaaaatcaggaatgcag
tattcaaaccatgacataaactcctatttttaaaggagaggtgggtcatgggctatggct
gatggaactagtaaataatgcacaaaatggcattttaaaatgaaaactggtatggatttc
ttcattactaacatctctatggatgtctaagctcttctgagttttcattgtatgcatatg
ggtcagcataaaaatgaaggtttattaggattcaaggccatgacattttaaaaaatgagg
ctggtatctcaatggatatctctgggcagaatatttaaataaagataatttgaaatgtgg
tacaaacattttgaaataaacaactaaagatcctctaaaaacggccacattgtttttcgc
tttgcttcaaggacaagcatgatgcatataaccttttccttttatctttctttcagcttc
ttactgcttctgattagtgacctcaattgagactcattgctcattgcaaagactgctaat
ggattgtttgagcctgaatgtgttaggatggaatatttcttcttctcagattcaaggcca
gtttttttccaccccaagtccattctacccagagttctagatgatgatggtcaggttatt
caagataatgattatgttttctagatgatttaaaatgaagttcaacttttattatcttcc
ctataatgatatttgtagtctttatgttcaataacaagctgtcaggctgcctcagtttaa
gccaaggcattttcttatcaaaacccatcacagaaaaagatacaatcatgaaaccacaga
ttcttgtagctcttcacagtaaactttaactatgaataacctcttggattattagccgat
tgtgattacatttatattatttgctcacatgctttgtcactttagagccctgaaaaccct
gttcattgttgctaggagatgggtggctatggcaacagtgtgggtcagagccagatggaa
tgcctaaagcataatcaggtttaggcttttttttgatctccaaatgactccatggcagtc
ctgagcacggaagccccaaatcactgcctcttcagcttgtttcaaaaggtatgccacatg
gtttctcctcacacatcagctctccccattaacaagtgtctttctggtgcttaactagac
accaagagttgtctgaaaaagaaaaaagctggataacaagggggattatcactatttaac
tgtgttttcatactgttattaatttagttcagatctagtgccatatgcttctcttcatca
ttccactgaactcctagtgactttcatggaagttccacacaaagaatgagggcgacatat
ggttctaatagtggtttgttcattcctctaagattgatgggtattttaaagacattaatc
attatatttaagacaccctttaatttcttcagaaggccggatcttcactgatttatagga
gtccttaccacacagccatacctattttgcttttcttttaaaacttggcatcaagagaaa
aatattgacatgttcctcttataataaagtaaaaatgtaacaaattaaagttataaataa
tggtaggaatttatctattattctaaaaataacttgtttattggaccacaaaagtcctaa
gcaatttattcatcattttcattgtgtctttcttcctcaagaaattccccctcttaccta
caacaaatccacactctgggcctcgtcttcttccacctggaccccatcaatccagccagc
ataatttattcccctatacaaatctttcctctgatcagatcagaagaattatctcattac
ctctcccttcctagtctcaccccttgcaactattccctcacacagattatctctatttct
gtatctttgctcctgccatgtcctaaaatgcctttttccatcttgaatactcatatttgt
tcaaatatttatcaggtaccctctaggtacctggcccctgtgctaggtgctagtatctaa
aaagagcataatgagagctccacactatctaacaagggtaacgggattcataaaatttaa
caatggatgttgtttttgaagtcacttctttactacatgcaagactcatttagacactat
tccttatttagtgctcataataaccctatgtcgttattatcattcacaaccaacagatga
aggtactcaggctcaagagtgtaaaggatttgcccaaggtcaaagggcccagtagcagca
aaatgagattggaaccgaggtctgtcttacttcaaaaatgataccaattactccattgtt
gatgagatatttcaataatgtaaatgtgtattattccaggctagaagccactaagggaga
cagtgatcagctccatttgggagggtcagggaggagttcctagggacaaggatgaagtta
acttataaataaggagtttgacagtgaacatagtagaaaaaggacgttttaggacaggag
ataaatgataaacttagaacttaaagccctttttagcttcttttgatatcaatcctctcc
gttctcccattttcctttctcaaagtgcaagtcaatacctaccacttccataatgctgct
aatctgcgtgttaacccttgttcatctctttctcttctaaaccctgatgccacttgtttt
gcagcagctccttacacctttatcagatactgtcttgtgctgctctcagttttccggacc
atacaaacgtggagggcaacggtcacacctttgatctattttgtatcttccaaagctgtg
tcagaaacatAGTAGATGATCCATGCATGCC
Primer
(+)CACCTAGCCAATATTTGGGCAGGT |
(+)GGCATGCATGGATCATCTACT |
|
