Mouse element [ mm1505 ]
Position: chr3:101,198,724-101,203,222 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory
Flanking genes:
Igsf3(intragenic)
Timepoints: e11.5
Expression Pattern branchial arch (10 out of 12 embryos) | facial mesenchyme (9 out of 12 embryos) | limb (12 out of 12 embryos) | somite (10 out of 12 embryos) |
Embryo 1
| Embryo 2
| Embryo 3
| Embryo 4
| Embryo 5
| Embryo 6
|
Fasta sequence
TGGAAATTTGGAAGCGGTGGattttagggagatggtatttggtttttgccactggggctt
tgagatccaagtaaagagaccttgaattcagtgaaacaatgaactatactctgaatgaga
ggccaggagctactgtgacgtgacaaaccatggatctgtagacatgctgacccgtagagg
acatgcttggcagcggttggtacagggtctgagtggcacgtggtcttcaggctgtggttg
ttttcctttgctgcctggatttcctcagggctctgcagcaaaggagtggagcttacaggc
caactttattttatccttgggagtctcaatgtcttgaacagcaggttttcagcctggctt
caggtcccttcagctatccagggagggaatccttggtcatgagtgacacggctgctgtct
ccatgggtcagtagaaagtcaagtgccttgcaggggggcactatgtggtgactggtatct
gttggtgaccatgataggcttgccaggcagggaaatgtggagctttaggaagaagcacta
gtcccaacgaggctgaattttcactcacatcttgtatttccctgctttgcaaacatccaa
aaggcaccctttgttaaagggtctggagcccagagctacgtgctgtctgtcagcttgcac
tccacacctagttaaggtgtaacctgtctgctgtctggctctcattactttcctaaaagc
acagggccccgtgagtgctggggtgggggaggggggcacttggcatctggttttcatcag
gcagcaagcaagtgccccagtgcatgtgggggaatctggctctttaaacaaagccaaggc
agagggagcgagcccctctccttctccttcttggctctgggagctcccgttgttgactcc
agaagcacccaaaggccagggagacagatgcattgcacactggagttgaaaaatggaaag
atgggcccaacactgtctgtcttcctaatggagcactgttcctcctgctctcccggaacc
cagagcatcacaagtgtttgtcaaggccatcttgctccctggcagcaactcgtatgttat
gctctgagctctcttgacagcccatgtctaggtttaatccctggaatagggcaatatgat
cagcccacctagtctttaagttgtctgtctgtctttctagtcatccacccatccagcatt
cagcaaacatttagagacagcagcatgacttagggcaaatcactgagccccttttcctag
ccagtaaatgaggagatgtgagcattgatgagttagctggcttcctcggggaaagcactt
ggtcctgccctagttggtggtaggcaccatgagtgttggccaggccagggttgccaccct
cctcagctgatgagccacaggttgtcttcagcatgctatggctatttggagcttggactt
atgccctagcacatagtctcaagccataaagatgtgacctttgatcatattgctacctcc
cttggcatttcattcttgtttcagactttgataaggccattgtgaccgcactccagaagt
cagggcccatatttggtggccactgagtgcttgccagtctggaatgtgacaggtgagtgt
aggcagcgtccaggtggcactgaagcatccttgtcagggcctcattgcctgagtctctgt
tgcccttcagtgtgcacttgccatttgaacatttctacttctacccttctttgtctttcc
agcctcctggcagtcatgtcctttggcatggtggcagggatttcttttgtttgccattct
ccctgtaccctgaacagggctgatccctcatgtcctcggctgtgtgtgaggctggaacca
gcattgccctcctgagtgtagggcagtggtagagcacttagtagaggtgatctggggaaa
gtccgcgattgatcactgggaggtgggtggggtcgctctgccctgagttagaggtgcagt
ataggcaggaaatgggcaggaaggcaagcccacccgcaggctgtcctggctggtggcggt
ggcctcaggcatgttctctcagcggtctttcacatctctgctgagctccatcttctgatg
acaattcactcacttctgcctctggccatctgtgacacctggaatgtgcttcaacactgg
ttccagctctctttcagttaattgaggaaatttgtctccccgtcggtgagccaagcgctg
ctgtggtcttgatggttaagtcgtgttgtgctaagaggcgtgagctctgctgcttgccgt
gtgtgacctcgtgtgtcctcaggttttcaagtttcttgaagtgtctggagctgttctgtg
tggggctcatctcccacgaagcctgaataaaaaggcattccactcaaggctagaccaagg
agtactctgtttgcattgatgcctgtgggagatgacagaactgctgaagcctgtgtgtcc
catgctgcagctgcaggggtcaaacggaacaagggggggacaagctgcaagtcacagcga
gttatgaagggaactttgtgctgcacttggggcagggcagggagggcatatgcacaaccc
ctcgttaagggtccaggaaatgaaatgctgaagccagcggttgaccctgagtagaggggt
cgggctgttgccaccaaactgctgctttgtgctgtccctgtccctcacaccccaccaagc
agcacttctgtgtgtcttctgacttccatgagttcttggtttccccacatctgtggcttc
cctgagtccagggatttcccaagtccatggcttctgggccacatgttttccaaccagaag
cagcgggacatttgtgttgcttccagtttgtggctattaagagggaagctgttgtgacac
ttgggtatttgagtggacttaggtttttgtttctcttgggtaaatgcctgggggtgtgat
tgctgccatccagtaactttatgcttaatttgatagggaatatccaggctgttttccaaa
gtggccataccaacccgcacgttcaccagtcctataaggaaagaacctgaaatctgactt
agaacccagagccttgcctgttaacattacagtgtccctggctgatgagtgtccctgtgc
tgtgagcctcccttttaccatagggtatcagggagagtgttaagtcccagggagccagtc
aatggtggagatgtttccttaaggaaacccttaaccagtacagggctgctttccccaaag
gccgccccctcccgctggttgctttcatctctgttatggccttggctgtcactaagattc
actggtggagttgctcagatgggtacccacttgtactctgtggacactggaacaatctgt
gctgtgtggctcacttcccatgtttttgtgggcacctaagatgctggctcctggccagag
atgaagttacagacatctgagcgaagaagctatgagatgtgaggacactgccttagcacc
tctgtagctgtgtgcgtgtgtgcatgcgtgtgcgcgtgcgtgtgcccgtgctgattgctg
gtgtgcaggctgtgaagggctgtccctgctttatggcccatttcaggcctggctttccct
gtccagggctcctcttgactggcaaccagactgtagtttcctgcattgctttcctgctag
gtcccttgtgttttgaaagagccaaaaccagacaggggcgctatcaggttacagctccgc
ttggtgtggagtctgaaaaggagagggaatgtaggaacatgtggttggatttactttctt
tttttttttttccttttcttatttgaggcagcacttcctgaggggggccactgataatta
ggctctctctgattcccgaggccccagtgaagtaaagcacaaatgttgttttctaaagga
ctgttgttgcggccaggccagtgtgcctgctgtggagctcctcctgcagcctgtgcgtct
ggaagctgcctcaccaagctaatgcatgtttgagaaagacagaggcaggcaagtgagtgt
gcctgcctgctgggatgaagatctgagattgaaagttcttcctggcccctattcctgcca
gtaccagcaactgtgggttgacctggcctttccagactttgccttccttaccatggatag
aagtcccatttagtctcacaaggggagagagaggatgtgtcacagcagaagcattttaac
ctatgtgacagtgtgacatctagaggtggccctgtctctgagcatgtgcttattaactgg
aggcaaaggcagcactcagaaagccacctactgtctcttcctgcgacccattggtccctg
tgcctgtccatccaagaggaccgtgtgcccaggattgattttggcaggctggcttccttc
ttgcctttgagcataggaaggtgtggaaatgccagtggcctggaagtatttgggagaaat
agatgtgatgtcacatggaggagaggtttctagatgggtCTTGAGAGCAGGGACAGGAA
Primer
(+)TGGAAATTTGGAAGCGGTGG |
(+)TTCCTGTCCCTGCTCTCAAG |
|