Mouse element [ mm1462 ]
Position: chr11:113,644,681-113,649,107 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory
Flanking genes:
Sdk2(intragenic)
Timepoints: e11.5
Expression Pattern dorsal root ganglion (7 out of 12 embryos) | forebrain (7 out of 12 embryos) | hindbrain (rhombencephalon) (9 out of 12 embryos) | limb (7 out of 12 embryos) | midbrain (mesencephalon) (8 out of 12 embryos) | neural tube (9 out of 12 embryos) | trigeminal V (ganglion, cranial) (7 out of 12 embryos) |
Embryo 1
| Embryo 2
| Embryo 3
| Embryo 5
| Embryo 6
| Embryo 7
|
Fasta sequence
ACTGCTGCATCATGGACACTaatgctaagtgagcactgatgtgggaatactgctgcatca
tgggtactgttgctaagtaagtactgatgttgtgggagtactactgctgcatcatgggta
ctgttgctatgtgagtactgatgttgtgggagtactactgctgcatcatggactctaatg
ctaagtgagcactgatgtgggaatgctgctgcatcatgggtactgttgctaagtaagtac
tgatgttgtgggagtactcctgctgcatcatgggtactgttgctatgtgagtactgatgt
tgtgggagtactcctgctgcatcatgggtactgttgctatgtgagtactgatgttgtggg
agtatttctgctgcaccatgggtactagtgctgtgagtactgatgttgtgggagtactcc
tgctgcatcatgggactgttgctatgtgagtactgatgttgtgggagtactactgctgta
tcatggacactaatgctaagtgagcactgatgtgggaatactgctgcatcatggacacta
atgctaagtgagcactgatgtgggaatactgctgcatcatgggtactgttgctaagtaag
tactgatgttgtgggagtactcctgctgcttattgttgctatgaaaatactaaggcttca
tgggtactgcggtgaatgagtgctcacactatgtgactcagctactgactctgtgaatac
taaggggcttgtgtgagcactaacattgcatgggtactagtaccatgtaagtacttattg
tgtgtgagtactgatgctaagtgaaagagaacactgggcctggagagatggctcagcagt
taagagcactgactgctcttctgaaggtcctgagttcaaatcccagcaaccacatggtgg
ctcatgaccatctgtaatgagatctgacgcctccttctggtatgtctgaagacagctaca
gtgtatttagatatgataataaaaataaatcttaaaaaacaaacaaaaaccaaaaacaac
aacaaaaaaagaaaaagaaagagagcactaatgcccagtgagtactactggtgtgcaggt
actggtactaggtactgactgagtgctgatgctatgttagtacttatgctgcacgggcat
gagtactttgtgtgctgatgctgaatgcagagacagtgggtttgctgggatgcagctctg
gtggggctttaactcagatctgcctgttctctgatgtccaccctggcacttaacttgcac
ttactccagggttcctggaagagagtgagagtccctcccttgactcccagggagacaaac
actccccagccaatggctaacttccttcccttcctttgattccacccttgctctccacct
ttctgcagtctcagcttctcccccttgcagcctccaagtacccatcctccccaggaaggt
aggcccacaatggacagccctgccagtcaattagctttgggttcagggcagcacaatgtg
agccatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcccatctgtcttccc
agaacaaaagacataacaagaaggatccatatgttgaggccaggctaatactctgaggcc
agaggctgggggccatagtggtggttgtggcagtgataggtgtgggggtagggtggtttg
tctctcttctggtagggtctgggggtgtagagaaccaggttagagcattctactagcttc
ctgtcttggaagagcttgccagtgtctccaaggcatctagaattttccgctagccctagg
cttccacatttgggaggagttccagatcacagtgtgccacttctacaatgcatgcgcctc
tggggtcagaggtggtgccatggcccttgttagtaaagcatgtttgtaaccaacactggc
aggctttaggccttggtggactgatctgcaaaatggtagcttgtgacctattaggtgaag
aggagccaaagcaggcaggagtagaataaatgatattatttggggagaaaggctggggca
gggacagagtttcagtgggagagatcacaaggggccagggattggacagtgcctccgtga
cgtcactggaacggaacagcctcccttgctaggcaacagtgggtggcgtctgatttgggg
gttgtgctgggtccactctggctcttccaggcccaaatctcaaagcctgtttatctatac
tacctcagaccagcagctgctatctcctgagcgcccactggatgcctggccctctgggaa
gacagccctgacagatgggaaggctggaagtgggggttgggggtgctgaggtggggtctg
agctgttagctagtccctcctccagctccctggggtcaaggaggaagggggggggtgtct
ttcccccagactaacagggcagttaccgcctccacctccccgaacatctgtttcttttca
gggtgggggtggggtgagaagaaagagtgcgaggggagccaggggctccgattgtagctt
tcaaccctctctcagtaactgaatgcggtgtcccgggagcgggcaagcacaaagggggct
ttcagggaccatcctgccaggccggcaagcgactgcttcagttccctggcctcttaacag
ctcctcaaagccactcaatcagcaattactcggtcgaaggagcgggagggagggcagacg
ccaggcttggggacaggagtgggggagggacccagaaggagggccaattgtagagacaaa
agctgaaatctcaaagtggaaaaaaagccctttgctcgttttcttgtctcttgtaccaga
ctcagctagctggtaaaggttccggatgacgagctcagggcgtaaggggcaggtttgagg
tatgggaccaggcaggtaatgtgtgtgtgtttatgtgtgtgtgtgtatgtgatgtgtatt
gtacccgtgtttgtgtgtttgagtgtgcatgtctctgtttttattttgaggacttcagag
actatgagaccccccctcatctggggtcccaggggatcggtcctgtctgatcacactctg
gacatagtgctctgtcccttggataagctaacttttggggcagtgtggctaccttcttca
gggttggagaggttgctgacatgctaaggggcccctgagaatcttcagaggactccactg
attttcctgtgagggctcattttcagaactttgggctccccgtgtgaaaacaacttgaga
gatgtcagcctatgcaagccatatgtctgtctaggatgtctgtggtcaagggccttgagg
gaagttccggagggaggtttgggaatggatgttgtcctcagagtcatcaggacagacaga
gtcccagtcacctgctcttctgagctctgtaaccaagagcttaatgttggccatctctga
gtatccgaatcccccagtgccttatgggacatcaacttgttaccaaggcagggctcttag
gctctaaatgagatgcataaagtataaggtttggcatggataaggtattgaccaacttct
ctgtcctgtgctatctttctctttgggctaaggagaggagagagacaagacagggcctta
gctgagcccgttccagggatggcccaacctgatggacaagaaacaaaacggacaagaaga
tgagaaacattcaacagacaggaggccttaggggaaggggacagtgtacctgactcggac
cagcacataccaaatgagtacccgcatcttctaggaacaccccccccccccccgacatcc
ctctgtcacatgcctttgggtagtgtctcttcagtgcctcaacttcctcaaacggcagga
aatagaacgaagttaggatatccctttcttcctacagttagtcgttatggttccgtgata
tttgagaaccgagatgtgtggttattaacgcacaggtggccctctccggcagaccataat
aggatgtcacaaagcatcttttgcttactgcttcagctactaccattgatgtgtctggtg
ctattcaaacctgggacccataaccctacccctaactctagccctgttaacatacaagca
gtgctgctggcccgatatcaggggcccagtgactggttacgtcaccaccgccaccgggtg
tgctaggcgtctgttgcagggtcccatcacccaccactgtctctgtctgcatgatctctt
tcgatctctgcctgccccaacttctctgtcttcctctctgcatgtgacttccctggcccc
gttctttgagaccagtgagccccacccccccaagagctgcctccaataaacccgcttcta
tactcttgattcagcttgaattggcttattttgttggtggagaaaacctattatctggta
ccattcagtggtgtggtccaatagctgTTGAATGCGAACCCCAAGGA
Primer
(+)actgctgcatcatggacact |
(+)tccttggggttcgcattcaa |
|