Mouse element [ mm2058 ]Position: chr13:14,884,747-14,890,193 (UCSC browser) Source: Lawrence Berkeley National Laboratory Flanking genes: AW209491 - Gli3 Timepoints: e11.5 This sequence did not show observable enhancer activities at E11.5 We define a negative enhancer at this developmental stage when at least 3 transgenics were obtained and yet no reproducible pattern of expression was observed. This does not mean that this sequence is not an enhancer at another time point or a weak enhancer at this time point but below the detectable range at our level of resolution. Fasta sequence AGGGTCTAAATGGTCCATCCtttcacctcagctccaaactttgtctctgtaactctttcc atgagtgttttgttcccaatcctaagaaggggcaaagtgtccatattttggtcttcattc ttcttgagattcatgtgttttgcagattatatcttgtatcttgggtattctaagtttttg ggttaatatccacttatcagtgagtacatatcatgtgagttcttttgtgattggattacc tcactcaggatgatgccctccaggtccatccatttgcctcagaatttcataaattcattc tttttaatagctgagtagtactccattgtgtaaacaatgtacatttcctgtatccattcc tctgttgagggacatctgggctctttccagcttctggctattataaataaggatgctatg aacatagtgaagcatgtatccttcttaccagttggaacatcttctggattaatgcccagg agaggtattgctggatcctccggtagtactatgtccaattttctgaggaacctccagact gatttccagagtggttgtacaagcttgcaatcccaccaaaaatggaggagtgttcctctt tctgcacatccttgctagcatctgctgtcacctgagtttttgatcttagccattctgact ggtgtgaggtggaatctcagggctgctttgaatgcatttccctaatgattaagggtgctg aacatttttcaggtgcttctcagctattcggtattcctcaggtgagaattctttgttcag ctctgagccccattttttaatggggttatttgattttctggagcccaccttcttgagttc tttatatattttggatattagtcccctatccgatttgggataggtaaagatcctttccca atctgttggtggcctttttgtcttattgacagtgtcttttgccttacagaagcgttgcaa ttttatgaggtcccatttgtcgattctcaatcttacagctcaagccattgctgttctatt caggaattttccccctttgcccatattgttgaggcttttctccactttctcctctataag tttcactgtctctggttttatgtggagttccttgattcacttagatttgaccttagtaca aggagataggaatggatcaattcacattcttctatatgataaccgccagttgtgccagca ccatttgttgaaaatgctgttttttcccctcactggatggatttagctcccttgtcaaag atcaagtgaccataggtgtgtgtgtgggttcatttctgagtcttcaattctattccattg gtgtacttgtctgtcactataccagtaccatgcagtttttataacaattgctctgtagta cacctttgggtcaggcatggtgattccaccagaggttcttttatccttgagaagagtttt tgctatcctaggttttttgttattccagatgattatgcagattgccctttctaattcgtt gaagaactgagttggaattttgatggggattgcattgaatctgtagattgctttggcagg atagccatttttactatactaatcctgccaatccatgagcatgggagatctttctatctt ctgagatcttctttggtttctttcttcagagacttgaagttcttatcatacagatatttc acttccttagagtcacaccaaggtattacacattatttgtgactattgtgaaaggtgttg tttccctaatttctttctcatcctgtttatcctttgtgtagagaaagaccactgatttgt acttcagtgaagctgtttatcaggtttaggagttctctggtggaatttttagggtcagtt atatatactatcatatcatctgcaaatagtgatattttcacttcttcctttacattttgt atcatcttgacctactttttttgtcgaattgctctggctaggccttcaaatactatgttg aataggtatggagaaagtgggcagccttgtgtagtcactgattttagtgagattgcttcc agcttctcaccatttactttgatgttggctactggtttgctgtagattgcttttatcatg tttaggtatgggccttgaattcctgatctttccaagacttttatcatgaatgggtgttgg attttgtcaaatgctttctctgcatctaatgagatgatcatgtggttttttgcctttgag tttgtttatatactggattacgttgatggatttccgtatattgaaccacccctgcatcaa tgggatgaaacctacttggtcaggatggatggttgttttgatgtgttcttggattcggtt agcgagaattttattgagtatttttgcatcgatattcatagaggaaatttgtctgaagtt ctctatctttgttgggtgtttctgtggtttaggtatcagagtaattgtggcttcatagaa tgaattggatagaggaacttctgcttctattttgtggaatagtttgcgaagtactggaat tagatcttctttgaagatctgatagatctctgcaataaacctatctggtcctgggatttt tttggttgggaaactattaatgactgcttctatttcttttggggatataggaccgtttag atcattaacctgattctggtttatctttggtacctggtatctgtctagaaacttgtccat ttcatccaggttctccagttttattgagtatagcctttggtagaaggatctgatggtgtt ttagatttcttcaggatctgttgttatgtttcccttttcatttctgattttgtttattag gatgctgtccctgtgccctctagtgagtctggctcagggtttatctatcttgttgatttt ctcaaagaaccagctcttcatttggttgattctttgaatagttcttcttgtttccacttg gttgattttgcccctgagtttggctatttcctgctctctactgctcttggttgaattttc ttccttttttctagagcgtttaggtgtgttgtcaagctgctagtgtgtgctctctctagt ttctttttggaggcactcagagctatgagtttccctcttagaaatgctttcattgtgtcc tataagtttgggcatgttgtggctttgttttcattaaactctaaaatgtctttaatttct ttctttattccttccttgaccaaggtatcattgtagagagttttgttcagtttccacttg aatgttggctttctattatttatgttgttattgaagatcagccttagtccatggtgatct gatgggatgcatgggacaatttcaatatttttgtatctgttgaagcctgttttgtgacca attatatggtcagttttggagaaggtatcttgaggtgctgagaagaaggtatatcttttt gttttaggataaaatgttctgtagatatctgttaaatccatttgtttcataacttctgtt agtttcactgtctccctgtttattttctgtttccatgatttgtccattgatgaaagtggt gtgttgaaatctcccactattattgtttgaggtgcaatgtgcactttgagctttactaaa gtttctttaatggatgtggctacccttgcatttggagcatagatattcagaattgagagt tcctcttggaagatttttacctttgatgagtatgaagtgtccctccttgtcttttttgat aactttgggttggaagtcaattttattatatattagaatgactactgaagtttgtttctt tagaccatttgcttggaaaattgtttgccagccttgcatctgatgtagtgtctgtctttt cccctgagatgggtttcctgtaagcagcaaaatgttgggtcctgtttgtgtagccagtct gttagtctatgtctttttattggggaattgagtccattgatattaagagatattaaggaa aagtcattgttgcttcctattatttttgttgttagagttgacattctgttcttatggctg tcttcttttaggttcgttgaaagatcactttcttgctttttctaggacattgtttctgtc cttgtattgttttttttttttttttcttctgttattatcctttgaagggctggattcatg gagagataatgtgtgaatttggttttgtcatggaattctttcgtttctccctctatgtta attgaaagtttggctgggtatcgtagcctgggctggcttttgtgttctcttagtgtgtgt ataacacctgtccaggatcttctggctttcataatctctggtgaaaagtctggtgtaatt ctgataggtctgcctttatatgttacttgacccatttcccttactgcttttaatattcta tctttatttagtgcatttgttgttctgattattatgtgtcaggaggaatttcttttctgg tccagtctatttggagttctgtaggcttcttgcatgttcatgggcatctctttctttagg tttgggaagttttcttctataattttgttgaagatatttgctggactttaagttgaaaat cttcattctcatttactcctattatctgtaggtttagtcttctcattgtgtcctggattt cctggatgttttgatttaagatctttttgcattttgtattttctttgattgttgtgccga tgttctctattgaatcttttgcacctgagattctctcttccatcccttgcattctgttgc tgatgcttgaatctaaggttccagatttctttcctagggtttctatctacagcattgcct cactttgggttttttttttttattgtgtctacttcccttgttaggtctagtattgttttg ttcatttccatcacctgtttggatgtgttttcctgtttttctataaggacttctacctgt ttggttgtgttttcctgtttttctttaaggacttctaactctttagcagtgttctcctgt ctttctttaagtgagtcattaaagtccttcttgatgtcctctgccatcatcatgagatat gcttttaaatctgggtctagattttcggctgtgttgggatgcccaggtctgggcgaggtg ggagtgctgctttctgatgatggtgagtggtcttgttttcttttagtaagattcttacct ttgcctttcaccatctggtaatccctggagttagttgttatcctcttgtgattctgttag cctgtatcagtagaactgggagaatagctctctcctctgagtttcagtggtcagagcatt ctcttcaggcaagctttcctcctacagggaaggtgcacagatatctggtgttcggacctg cctcctggcagaaaatgaaggcctgaaacaggacctgtcccagaatctgtgtcacttcgg cctgtcaaagaagctgttagcttctgtAGTTCACACTCTCACCTGCGPrimer
|
For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.