Mouse element [ mm2044 ]Position: chr13:14,973,023-14,978,262 (UCSC browser) Source: Lawrence Berkeley National Laboratory Flanking genes: AW209491 - Gli3 Timepoints: e11.5 This sequence did not show observable enhancer activities at E11.5 We define a negative enhancer at this developmental stage when at least 3 transgenics were obtained and yet no reproducible pattern of expression was observed. This does not mean that this sequence is not an enhancer at another time point or a weak enhancer at this time point but below the detectable range at our level of resolution. Fasta sequence CCCTGAATTAGGAAGGAGGTttctcactgagttgagaagggaattactcaacaaaatgag aaggagatctatgattgacattgaaatcattgaagtgtgaaggacatcaatcattgaatt gggaagatttctggctgaattcagatgtaattattgattttattgaggatatcattgttt tagttttcttttttccttttcttatattggattttaataaaaatgttattacatatatta ctcatttacatttccgatgctatcccaaaaggcccccataccctccctctactcccctac ccacccactcccacatcttggccctggcgttcccctgtactgaggcataaaagtttgcaa gaccaaggggcctcctttccactgatggccggctaggccatcttctgatacatatgcagc tagagacacgagctccaaggggtactggttagttcatactgttgttccacctatagggtt gcagatccctttagcttcttggatactttctctagctcctctaataggggccctgtgatc cattcaatagctgactgtgagcatccacttctgtgtttgctaggccacagcatagtctca caagagacagctatatcagggtcctttcagcaaaatcttgctagtgtatgcaatggtgtc tgcgattggtggctaattatgggatggatccccggatatggtagtctctagatggtccat ccttttgtctcagctccaaactttgtctctgtaactccttccatgggtgttttgttccca attctaagaaggggcaaagtgtgcactccttggtcttcattcttgagtttcatctgcttt gtatcttgtatcttgagtattctaagtttctgggctaatatccaattatcagtgagtaca catcatgtgagttcttttgtgattgggttgcctcactcaggacaataccctccagctcca tccatttgcctaggaatttcataaattcattctttttaatagctgagtagtactccattg tgtaaatgtaccacattttctgtatccattcctctgttgagggacatctgggttctttcc agcttctaactcttataaataaggctgctatgaacatagtggagcatgttttcttattac cagttggaacatcttctggatatatgcccaggagaggtattgctcaattctctggtagta ctatgtccaattttctgaggaaccgccagactgatttccagagtggttgtaccagcttgc aatcccaccaacaatggaggagtgttcctctttctccacatccttgccagcatctgctgt cacctgaattttttatcttagccattctgtctggtgtgaggtagaatctcagggttgttt tgatttgcatttccctgatgattaaagatgttgaacatttttcaggtacttctcagccat ttgatgtttcccatttgagaattctttgtttagctctgtgcctcattttttaatggggtt attgattttctggagtccatcttcttgagttctttatatatattggatattagttcccta tctgatttaggattggaaaacatcctttcccaatctgttggtggcctttttttcttaatg acagtgaagaattgagttggcattttgatggagattgcattgaatctgtagattgctttt gccttacagaagctttgcaattttatgaggttccatttgtcaattcttgatcttacaaca caagacagtgaggttttattctggaatttttcccctgtgcccatatcattgagttttttc cccactttctcctttatacgtttcagtatctctggttttatgtggagttccttgatccac ttagacttgaccttagtacaaggaataagaatggatcaatttgcattcttctacatgata atcggcagttgtgccagcaccatttgttgaaaatgctgtctttttttagctcccttgtca aaatgaccataagtgtgtttgttcatttctagaattcaattctattccattggtctactt gtctgtccctgtatcagtaccatgcagtttttgttgtgtttttttttgtttttgtttttg ttttttttaatcacaattgctctgtagtacagctttaggtcaggcatggtgattccatca gaggttcttttatccttgagaagagtttttgctatcctaggtttttttgtaattccagat gaatttgcagattgctctttctaattcgttgaagaattgaattggaattttgatggggat tgcattgaatctgtagattgcttttggcaagatagccatttttacaatgttgatcctgcc aatccatgagcatgggagatctttccatcttctgagatcttctttaatttctttcttcag agacttgaagtttttatcatacaaatctttcacttccttagttagagtcatgccaagata ttttatgttatttgtgactattgagaagggtgttgtttccctaatttctttctcagcctg tttatcctttgtgtacagaaaggccattgacttgtttgagttaattttatatccagccac ttcaccgaagctgtttatcaggtttaggagttctctggtggaatttttagggtcacttat atatactatcatatcatcttcaaaaagtgatattttgacttcttcttttccaatttgtat ccccttgatctccttttgttgtcgaattgctctggctaggacttcaagtagggagaaagt gggcagccttgtctagcccctgcttttagtgggattgcttccagcttctcaccatttact ttgatgttggctactggtttgctgtagattgcttttatcatggttaggtatgggccttga attcctgatctttccaagacttttatcatgaatgggtgttggatcttgtcgagttctttt tccgtatctaacgagatgatcatgtggtttttgtctttgagtttgtttatataatggatt acattgatggattttcgtatattaaaccatccctgcatccctggaataaaacgtacttgg tcaggatggatgattgctttaatgtgttcttggattcggttagcaagaattttattgagt atttttgcatcgatattcataaggaaaattggtctgaagttctctatctttgttggatct ttctgtggtttaggtatcagagtaattgtggcttcatagaatgagttgggtagagttccc tctacttctattttgtggaatagttcgtgcagaactggaattagatcttcgttgaaggtc tggtagaactctgcactaaacccatctggtcctgggctttttttgggtgggagactatta atgactgcttctatttctttaggggatgtgggactgtttagatcattaacttgatcctga tttaactttggtacctgctatctgtctagaaatttgtccatttcgtccaggttttccagt tttgttgagtatagccttttgtagaaggatctgatggtgttttggatttcttcatgatct gttgttatgtctcccttttcatttctgattttgttaattaggattttgtccctgtgccct ctagtgagtctagctaagggtttatctatcttgtggattttctcaaagaaccaactcctc gtttggttaattctttgaatagttcttcttgtttccacttggttgatttcacccctgagt ttgattatttcctgccctctactcctcttgggtgaatttgcttccttttgttctagagct tttagatgtgttgtcaagctgctagtgtgtgctctctccagtttcttcttggaggcactc agagctatgagtttccctcttagaaatgctttcattgtgtcccataggtttgggtatgtt gtggcttcattttcattaacgtctaaaaagtctttaatttctttctttattccttccttg accaaggtatcattgagaagagtgttgttcagtttccacatgaatgttggctttccatta tttatgttgttattgaagatcagccttaggccatggtggtctgataggatgcatgggaca atttcaatatttttgtatctgttgaggcctgttttgtgaccaattatatggtcaattttg gagaaggtcccgtgaggtgctgagaagacggtatatccttttgttttaggataaaatgtt ctgtagatatctgtcagatccatttgtttcataacttctgttagtttcagtgtgtccctg tttagtttctgtttccacgatctgtccattgatgaaagtggtatgttgaagtcttccatt cttattgtgtgaggtgcaatgtgtgctttgagctttactaaagtttctttaatgaatgtg cctgcccttgcatttggagcatagatattcagaattgagagttcctcttggaggatttta cctttgatgagtatgaagtgtcccttcttgtcttttttgataactttgggttggaagtca attttatccgatattagaatggctactccagcttgtttcttcagaccatttgcttggaaa attgttttccaacctttcactctgaggtagtgtctgtctttttccctgagatgggtttcc tgtaagcagcaggatgttgtctcctgcttgtgtaaccagtctgttagtatatgtcttttt attggggaattgagtccattgatattaagagatattaaggaaaagtaatcgttgcttcct tttatttttgttgttagagttggcattctgttcttgtggctgtcttctttttggtttgtt gagggattactttcttgcttgttctagggcatgatttctgtccttgtattggttttttct gttattatcctttgaagggctggatttgttgaaagataatgtgtgaatttgattttgtca tggaatattttggtttctccatctatggtaacttagagtttggccaggtatagtagactg ggctggcatttgtgttctcttagtgtctttataacatctgtccaggctcttctggctttc atagtctctggtgaaaagtctggtgtaattctgataggccttcctttatatgttacttga cctttctcccttactgcttttaatattctctctttatttagtgcatttgttgttctgatt attatgtgtcaggaggaatttcttttctggtccagtctatttggagttctataggctcgt TGTATGTTCATGGGCATGTCPrimer
|
For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.