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Human element [ hs1800 ]


Position: chr8:106,602,865-106,607,408 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: ZFPM2(intragenic)

Timepoints:
e11.5

Expression Pattern
cranial nerve (8 out of 10 embryos) 
dorsal root ganglion (6 out of 10 embryos) 
midbrain (mesencephalon) (9 out of 10 embryos) 
trigeminal V (ganglion, cranial) (8 out of 10 embryos) 

Embryo 1


Embryo 2


Embryo 3


Embryo 4


Embryo 5


Fasta sequence
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Primer
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