Vista Enhancer Logo
Enhancer Browser banner
Vista Logo

Human element [ hs1577 ]


Position: chr5:91,927,845-91,931,024 (UCSC browser)
Source: Lawrence Berkeley National Laboratory

Flanking genes: ARRDC3-AS1 - NR2F1-AS1

Timepoints:
e11.5
e14.5

Expression Pattern
forebrain (10 out of 11 embryos) 
midbrain (mesencephalon) (6 out of 11 embryos) 

Embryo 1


Embryo 2


Embryo 3


Embryo 4


Embryo 5


Embryo 6


Fasta sequence
TGGCACACATACACACTGGAccctggagcctccagggtagatgaggtccgtggggtttga
agcctcaaaaaactcaacgtgaagacagaacggagcaccatcttgcaatttttgttgttt
tgtaagtacaagagtataattactagaattaagaaaaagaggtatgaagggcagtgtcac
tattccttcttccacctttatcatttcaagactgggtttaaaacagctggcaaaatatct
ttaaacagtggttgaggaaaatctcagtttttcttagctacacttaaatccatagaacac
tacttcctttgttagtaatgagttcaatttaggagaaaagttgtctcagctttggtggcc
aaaccatatgtttttgtaagctggttggactgcatgtcattaagtgtaaaaatctattgc
aaagctctcaaggttacattaaggcaatgcagagccttggactgccaggaagaaagacaa
ttcatagagggcttttagatgagcacattgtgccaaccaaagcagaagtcttcagtatcg
ttttccccacaacctcaaatcattataggcttcaagattatatttgttactcagcttgtg
agatgcaacctgtaaggttaaaaaaaaaaaaacgtcggtgatgacttccatcgctctcac
tgtgactatttgaaatcttcacaggtatgaggtcctttctcagattattttttctcccat
gaactctctggaaccacttatttcattttttaaaggcaaggtaacaaggaacacatcact
tcatatctatattgtcacatgcagcttctttgataaaactaccacaaaaggaaaagtacc
cccacaaatgtatccatggtttcagaggcatcttatagtacttcaatgttccatgatatg
agctgatttttccacttggtcctgaccttcttgccatctaaatacctttttatctatttt
agtactttattaaacttttattatgtgcccagtaagactatgtatactatttcctttcag
cctcacagtgagcatcaggtaagtattattattatctacctttttttcagatgtgaaaag
aaaacagcaggacgaccttagctgcaaggacacatggctatcacatggaggatcaagaac
ataagcccagagtccatacgtaatccaatatgccaccaagtccttattaaaagtgttaca
caaaactgcatctagcaaggaaacatgttaccttctgaacatgtctatggagaaaaaatc
tttaaaaatattttacatatatattcttaggaaaatagtggtttactgctacttacatac
ccaactaaatgaaactagaattttaaacacacaattactatcatctgatcaaatactcat
cactgaggagagtagagagtatttcatcagtatttcaaaactgatgtctatccatagcta
cttctctgatcttgggcctcagttcttgcatgtgtaaaataaaggagtgggcaggaattt
tggtcacaaaaactgtttttgagtctaaatactaatttttaagtcagattaaattaatct
tatagaacttgacattcttacagccctattactaaatctgcaggtaacagcagtgataga
gtaatactgtaaggaattaagctgaacccactcttacattctatgggtatgagtttatgg
acccatatttaagagcgagattattgtacttattagaattggtttctataggtaagtaaa
atcagggaaatagaggttgcctctattcaagagaataagaaataaggaacccaacctggg
ttccatttcttttagtttacatttttttcaggtttgtttactatgtgccaaacacaactt
aaaattaaagtaatattttacaagttattgctctaaagcaaaggaagaaaagggtctctg
cagggaagtgtttccctagagtcttcctaatactgattaacactagtttttgaaatgtta
attagttttgagcttaacagctagtcattgtctaaaagggcatggagcaaaacttttcaa
agtgtggactaaggagtatttaactccttaatgccaaggactggccatttactccattgc
tggccactgaaccatgagaatgccaggtctgattagctgtggtgattagcaggctgacat
taggactggaatcacttgtcatttgcttacattgacagactacctacagaactgtataac
ttttatcagtgcaatgcattccatttagtagtattatggaaagcatattttaaaaacttt
tatagactaagtttaatacagtgtatacactttttgaaatattacctaaaattactatat
tgtagtgattgtctttgtcatttaattggtataatggtagaaaatagagctttttgtttc
ttaggctgtatcttagagaccatatttattacttcttctaaatctgtgccatctaaattt
cacattttcctattgttctcagtagagtaggacccttttaaaagaacattcactaaaaac
ttcataaaagagaattcttatggggaaatatgtctttatagaagaggtacaatctgatta
agacaatggaaatcagaaaagtagtaagaaacaattgctctactcaaaaatgtttgttta
taaagcaaaaattctcgtacatctaggggatcatatgtatgaattcagcattatttacac
cattttgctactcagaaactgttgaaacatttgcccaaagtcttagaactaggtaccagt
ccgtatttttgaaaatgctctttctactgctacgatcttcacttttttgccttccttggc
aattacttaagcacatattggtaggtttttctcccttaacatttgtatataattcaattt
ctttaaccatattagggccaagaatctagtcttaaacaaactgaaaattctacatgaaat
gcagtaatcctattgtggaaaattctatttaagtatctatttaaactataaaaagacact
aaaatataaaaataagctatgttaaaaaattgttttacagagctgaaagacaagctcaca
aggaaaaatttgatgaatatcttaactacaaaggcacacagtgtaatataaggacacagg
tagtaagaaataaaggaatgagcagagtagatggtcttctAAAGGGGTTGATATTGGTGG
Primer
(+)tggcacacatacacactgga
(+)ccaccaatatcaaccccttt


For commercial licensing of the VISTA Enhancer Browser and its associated data please contact Virginia de la Puente (vtdelapuente@lbl.gov) at the Berkeley Lab's Innovation and Partnerships Office.